Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPNE7Q9UBL6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPNE7Q9UBL6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPNE7Q9UBL6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPNE7Q9UBL6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPNE7Q9UBL6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPNE7Q9UBL6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPNE7Q9UBL6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPNE7Q9UBL6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CPNE7Q9UBL6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPNE7Q9UBL6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CPNE7Q9UBL6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPNE7Q9UBL6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPNE7Q9UBL6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPNE7Q9UBL6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPNE7Q9UBL6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPNE7Q9UBL6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPNE7Q9UBL6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPNE7Q9UBL6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPNE7Q9UBL6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPNE7Q9UBL6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPNE7Q9UBL6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPNE7Q9UBL6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPNE7Q9UBL6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPNE7Q9UBL6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPNE7Q9UBL6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPNE7Q9UBL6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPNE7Q9UBL6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CPNE7Q9UBL6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CPNE7Q9UBL6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPNE7Q9UBL6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPNE7Q9UBL6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPNE7Q9UBL6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPNE7Q9UBL6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPNE7Q9UBL6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPNE7Q9UBL6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPNE7Q9UBL6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPNE7Q9UBL6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPNE7Q9UBL6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPNE7Q9UBL6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPNE7Q9UBL6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPNE7Q9UBL6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPNE7Q9UBL6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPNE7Q9UBL6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPNE7Q9UBL6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPNE7Q9UBL6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPNE7Q9UBL6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPNE7Q9UBL6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPNE7Q9UBL6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPNE7Q9UBL6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPNE7Q9UBL6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CPNE7Q9UBL6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPNE7Q9UBL6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPNE7Q9UBL6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CPNE7Q9UBL6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPNE7Q9UBL6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CPNE7Q9UBL6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPNE7Q9UBL6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPNE7Q9UBL6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CPNE7Q9UBL6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPNE7Q9UBL6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPNE7Q9UBL6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPNE7Q9UBL6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPNE7Q9UBL6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPNE7Q9UBL6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPNE7Q9UBL6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPNE7Q9UBL6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPNE7Q9UBL6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPNE7Q9UBL6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPNE7Q9UBL6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPNE7Q9UBL6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms