Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBI1

COMMD3, COMM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3Q9UBI1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COMMD3Q9UBI1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COMMD3Q9UBI1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COMMD3Q9UBI1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COMMD3Q9UBI1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COMMD3Q9UBI1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMMD3Q9UBI1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMMD3Q9UBI1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMMD3Q9UBI1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMMD3Q9UBI1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMMD3Q9UBI1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMMD3Q9UBI1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COMMD3Q9UBI1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COMMD3Q9UBI1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COMMD3Q9UBI1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COMMD3Q9UBI1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COMMD3Q9UBI1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COMMD3Q9UBI1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COMMD3Q9UBI1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COMMD3Q9UBI1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COMMD3Q9UBI1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COMMD3Q9UBI1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COMMD3Q9UBI1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COMMD3Q9UBI1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COMMD3Q9UBI1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COMMD3Q9UBI1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COMMD3Q9UBI1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COMMD3Q9UBI1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COMMD3Q9UBI1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COMMD3Q9UBI1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COMMD3Q9UBI1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COMMD3Q9UBI1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COMMD3Q9UBI1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COMMD3Q9UBI1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COMMD3Q9UBI1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COMMD3Q9UBI1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COMMD3Q9UBI1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COMMD3Q9UBI1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COMMD3Q9UBI1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COMMD3Q9UBI1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COMMD3Q9UBI1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COMMD3Q9UBI1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COMMD3Q9UBI1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COMMD3Q9UBI1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COMMD3Q9UBI1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COMMD3Q9UBI1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COMMD3Q9UBI1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COMMD3Q9UBI1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COMMD3Q9UBI1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COMMD3Q9UBI1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COMMD3Q9UBI1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COMMD3Q9UBI1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COMMD3Q9UBI1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COMMD3Q9UBI1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD3Q9UBI1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD3Q9UBI1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD3Q9UBI1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD3Q9UBI1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMMD3Q9UBI1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMMD3Q9UBI1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMMD3Q9UBI1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMMD3Q9UBI1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COMMD3Q9UBI1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMMD3Q9UBI1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMMD3Q9UBI1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMMD3Q9UBI1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
COMMD3Q9UBI1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COMMD3Q9UBI1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COMMD3Q9UBI1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COMMD3Q9UBI1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms