Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FRMD4AQ9P2Q2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
FRMD4AQ9P2Q2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRMD4AQ9P2Q2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRMD4AQ9P2Q2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRMD4AQ9P2Q2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRMD4AQ9P2Q2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FRMD4AQ9P2Q2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FRMD4AQ9P2Q2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FRMD4AQ9P2Q2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FRMD4AQ9P2Q2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FRMD4AQ9P2Q2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FRMD4AQ9P2Q2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FRMD4AQ9P2Q2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FRMD4AQ9P2Q2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FRMD4AQ9P2Q2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
FRMD4AQ9P2Q2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FRMD4AQ9P2Q2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FRMD4AQ9P2Q2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FRMD4AQ9P2Q2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FRMD4AQ9P2Q2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMD4AQ9P2Q2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMD4AQ9P2Q2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FRMD4AQ9P2Q2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FRMD4AQ9P2Q2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
FRMD4AQ9P2Q2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FRMD4AQ9P2Q2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FRMD4AQ9P2Q2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FRMD4AQ9P2Q2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FRMD4AQ9P2Q2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FRMD4AQ9P2Q2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
FRMD4AQ9P2Q2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
FRMD4AQ9P2Q2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
FRMD4AQ9P2Q2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FRMD4AQ9P2Q2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FRMD4AQ9P2Q2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FRMD4AQ9P2Q2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
FRMD4AQ9P2Q2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FRMD4AQ9P2Q2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FRMD4AQ9P2Q2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FRMD4AQ9P2Q2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FRMD4AQ9P2Q2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FRMD4AQ9P2Q2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FRMD4AQ9P2Q2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FRMD4AQ9P2Q2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FRMD4AQ9P2Q2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FRMD4AQ9P2Q2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FRMD4AQ9P2Q2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FRMD4AQ9P2Q2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FRMD4AQ9P2Q2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FRMD4AQ9P2Q2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
FRMD4AQ9P2Q2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FRMD4AQ9P2Q2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
FRMD4AQ9P2Q2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMD4AQ9P2Q2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMD4AQ9P2Q2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMD4AQ9P2Q2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FRMD4AQ9P2Q2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMD4AQ9P2Q2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMD4AQ9P2Q2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMD4AQ9P2Q2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMD4AQ9P2Q2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMD4AQ9P2Q2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FRMD4AQ9P2Q2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FRMD4AQ9P2Q2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FRMD4AQ9P2Q2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FRMD4AQ9P2Q2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FRMD4AQ9P2Q2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FRMD4AQ9P2Q2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FRMD4AQ9P2Q2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FRMD4AQ9P2Q2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FRMD4AQ9P2Q2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FRMD4AQ9P2Q2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FRMD4AQ9P2Q2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FRMD4AQ9P2Q2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FRMD4AQ9P2Q2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FRMD4AQ9P2Q2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FRMD4AQ9P2Q2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FRMD4AQ9P2Q2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FRMD4AQ9P2Q2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FRMD4AQ9P2Q2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FRMD4AQ9P2Q2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FRMD4AQ9P2Q2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FRMD4AQ9P2Q2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FRMD4AQ9P2Q2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FRMD4AQ9P2Q2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FRMD4AQ9P2Q2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FRMD4AQ9P2Q2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FRMD4AQ9P2Q2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
FRMD4AQ9P2Q2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
FRMD4AQ9P2Q2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FRMD4AQ9P2Q2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FRMD4AQ9P2Q2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FRMD4AQ9P2Q2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FRMD4AQ9P2Q2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FRMD4AQ9P2Q2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms