Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2F8

SIPA1L2, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L2Q9P2F8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SIPA1L2Q9P2F8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SIPA1L2Q9P2F8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SIPA1L2Q9P2F8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SIPA1L2Q9P2F8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
SIPA1L2Q9P2F8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SIPA1L2Q9P2F8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SIPA1L2Q9P2F8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SIPA1L2Q9P2F8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SIPA1L2Q9P2F8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SIPA1L2Q9P2F8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SIPA1L2Q9P2F8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SIPA1L2Q9P2F8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
SIPA1L2Q9P2F8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
SIPA1L2Q9P2F8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
SIPA1L2Q9P2F8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
SIPA1L2Q9P2F8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SIPA1L2Q9P2F8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SIPA1L2Q9P2F8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SIPA1L2Q9P2F8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SIPA1L2Q9P2F8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SIPA1L2Q9P2F8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SIPA1L2Q9P2F8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SIPA1L2Q9P2F8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SIPA1L2Q9P2F8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SIPA1L2Q9P2F8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SIPA1L2Q9P2F8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SIPA1L2Q9P2F8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SIPA1L2Q9P2F8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SIPA1L2Q9P2F8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SIPA1L2Q9P2F8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SIPA1L2Q9P2F8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SIPA1L2Q9P2F8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SIPA1L2Q9P2F8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SIPA1L2Q9P2F8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SIPA1L2Q9P2F8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
SIPA1L2Q9P2F8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SIPA1L2Q9P2F8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SIPA1L2Q9P2F8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SIPA1L2Q9P2F8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SIPA1L2Q9P2F8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SIPA1L2Q9P2F8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SIPA1L2Q9P2F8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SIPA1L2Q9P2F8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
SIPA1L2Q9P2F8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SIPA1L2Q9P2F8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
SIPA1L2Q9P2F8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
SIPA1L2Q9P2F8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SIPA1L2Q9P2F8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SIPA1L2Q9P2F8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SIPA1L2Q9P2F8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SIPA1L2Q9P2F8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SIPA1L2Q9P2F8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
SIPA1L2Q9P2F8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
SIPA1L2Q9P2F8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SIPA1L2Q9P2F8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
SIPA1L2Q9P2F8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SIPA1L2Q9P2F8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SIPA1L2Q9P2F8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SIPA1L2Q9P2F8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SIPA1L2Q9P2F8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SIPA1L2Q9P2F8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SIPA1L2Q9P2F8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SIPA1L2Q9P2F8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SIPA1L2Q9P2F8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SIPA1L2Q9P2F8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SIPA1L2Q9P2F8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SIPA1L2Q9P2F8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SIPA1L2Q9P2F8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
SIPA1L2Q9P2F8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SIPA1L2Q9P2F8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
SIPA1L2Q9P2F8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SIPA1L2Q9P2F8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SIPA1L2Q9P2F8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SIPA1L2Q9P2F8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SIPA1L2Q9P2F8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SIPA1L2Q9P2F8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SIPA1L2Q9P2F8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SIPA1L2Q9P2F8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SIPA1L2Q9P2F8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SIPA1L2Q9P2F8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SIPA1L2Q9P2F8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SIPA1L2Q9P2F8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SIPA1L2Q9P2F8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SIPA1L2Q9P2F8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SIPA1L2Q9P2F8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SIPA1L2Q9P2F8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SIPA1L2Q9P2F8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SIPA1L2Q9P2F8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SIPA1L2Q9P2F8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SIPA1L2Q9P2F8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SIPA1L2Q9P2F8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SIPA1L2Q9P2F8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
SIPA1L2Q9P2F8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SIPA1L2Q9P2F8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SIPA1L2Q9P2F8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SIPA1L2Q9P2F8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms