Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B7

CFAP97, Cilia- and flagella-associated protein 97, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP97Q9P2B7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP97Q9P2B7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP97Q9P2B7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP97Q9P2B7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP97Q9P2B7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP97Q9P2B7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP97Q9P2B7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP97Q9P2B7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP97Q9P2B7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP97Q9P2B7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP97Q9P2B7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP97Q9P2B7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFAP97Q9P2B7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP97Q9P2B7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP97Q9P2B7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP97Q9P2B7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP97Q9P2B7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP97Q9P2B7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP97Q9P2B7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP97Q9P2B7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP97Q9P2B7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFAP97Q9P2B7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFAP97Q9P2B7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP97Q9P2B7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP97Q9P2B7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP97Q9P2B7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFAP97Q9P2B7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFAP97Q9P2B7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFAP97Q9P2B7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFAP97Q9P2B7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFAP97Q9P2B7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFAP97Q9P2B7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFAP97Q9P2B7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP97Q9P2B7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP97Q9P2B7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP97Q9P2B7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP97Q9P2B7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP97Q9P2B7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP97Q9P2B7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP97Q9P2B7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP97Q9P2B7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP97Q9P2B7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP97Q9P2B7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP97Q9P2B7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP97Q9P2B7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP97Q9P2B7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFAP97Q9P2B7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFAP97Q9P2B7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFAP97Q9P2B7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFAP97Q9P2B7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP97Q9P2B7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP97Q9P2B7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP97Q9P2B7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP97Q9P2B7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFAP97Q9P2B7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFAP97Q9P2B7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFAP97Q9P2B7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFAP97Q9P2B7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFAP97Q9P2B7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFAP97Q9P2B7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFAP97Q9P2B7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFAP97Q9P2B7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFAP97Q9P2B7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFAP97Q9P2B7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFAP97Q9P2B7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFAP97Q9P2B7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFAP97Q9P2B7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFAP97Q9P2B7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFAP97Q9P2B7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFAP97Q9P2B7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFAP97Q9P2B7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFAP97Q9P2B7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFAP97Q9P2B7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP97Q9P2B7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP97Q9P2B7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP97Q9P2B7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP97Q9P2B7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFAP97Q9P2B7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFAP97Q9P2B7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFAP97Q9P2B7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFAP97Q9P2B7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFAP97Q9P2B7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFAP97Q9P2B7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFAP97Q9P2B7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFAP97Q9P2B7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFAP97Q9P2B7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFAP97Q9P2B7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFAP97Q9P2B7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFAP97Q9P2B7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CFAP97Q9P2B7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP97Q9P2B7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP97Q9P2B7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP97Q9P2B7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP97Q9P2B7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP97Q9P2B7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP97Q9P2B7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP97Q9P2B7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFAP97Q9P2B7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFAP97Q9P2B7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CFAP97Q9P2B7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms