Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABRACLQ9P1F3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABRACLQ9P1F3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABRACLQ9P1F3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ABRACLQ9P1F3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABRACLQ9P1F3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABRACLQ9P1F3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABRACLQ9P1F3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABRACLQ9P1F3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRACLQ9P1F3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRACLQ9P1F3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRACLQ9P1F3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRACLQ9P1F3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRACLQ9P1F3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRACLQ9P1F3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABRACLQ9P1F3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABRACLQ9P1F3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABRACLQ9P1F3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABRACLQ9P1F3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ABRACLQ9P1F3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABRACLQ9P1F3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABRACLQ9P1F3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABRACLQ9P1F3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABRACLQ9P1F3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABRACLQ9P1F3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABRACLQ9P1F3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABRACLQ9P1F3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ABRACLQ9P1F3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABRACLQ9P1F3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABRACLQ9P1F3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABRACLQ9P1F3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRACLQ9P1F3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRACLQ9P1F3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABRACLQ9P1F3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABRACLQ9P1F3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABRACLQ9P1F3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABRACLQ9P1F3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABRACLQ9P1F3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABRACLQ9P1F3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABRACLQ9P1F3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABRACLQ9P1F3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRACLQ9P1F3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRACLQ9P1F3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRACLQ9P1F3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRACLQ9P1F3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRACLQ9P1F3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRACLQ9P1F3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRACLQ9P1F3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABRACLQ9P1F3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABRACLQ9P1F3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABRACLQ9P1F3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABRACLQ9P1F3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABRACLQ9P1F3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABRACLQ9P1F3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABRACLQ9P1F3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABRACLQ9P1F3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABRACLQ9P1F3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABRACLQ9P1F3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABRACLQ9P1F3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABRACLQ9P1F3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABRACLQ9P1F3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABRACLQ9P1F3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABRACLQ9P1F3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABRACLQ9P1F3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABRACLQ9P1F3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABRACLQ9P1F3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABRACLQ9P1F3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABRACLQ9P1F3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABRACLQ9P1F3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABRACLQ9P1F3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABRACLQ9P1F3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABRACLQ9P1F3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABRACLQ9P1F3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABRACLQ9P1F3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABRACLQ9P1F3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABRACLQ9P1F3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABRACLQ9P1F3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABRACLQ9P1F3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABRACLQ9P1F3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABRACLQ9P1F3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ABRACLQ9P1F3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABRACLQ9P1F3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABRACLQ9P1F3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABRACLQ9P1F3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABRACLQ9P1F3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABRACLQ9P1F3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ABRACLQ9P1F3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABRACLQ9P1F3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABRACLQ9P1F3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABRACLQ9P1F3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABRACLQ9P1F3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABRACLQ9P1F3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABRACLQ9P1F3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABRACLQ9P1F3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABRACLQ9P1F3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABRACLQ9P1F3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABRACLQ9P1F3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABRACLQ9P1F3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABRACLQ9P1F3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABRACLQ9P1F3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms