Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFA13Q9P0J0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFA13Q9P0J0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDUFA13Q9P0J0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDUFA13Q9P0J0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDUFA13Q9P0J0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDUFA13Q9P0J0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFA13Q9P0J0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFA13Q9P0J0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFA13Q9P0J0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFA13Q9P0J0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFA13Q9P0J0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFA13Q9P0J0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFA13Q9P0J0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFA13Q9P0J0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFA13Q9P0J0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFA13Q9P0J0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFA13Q9P0J0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFA13Q9P0J0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFA13Q9P0J0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFA13Q9P0J0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFA13Q9P0J0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFA13Q9P0J0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFA13Q9P0J0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFA13Q9P0J0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFA13Q9P0J0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFA13Q9P0J0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFA13Q9P0J0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFA13Q9P0J0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFA13Q9P0J0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFA13Q9P0J0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFA13Q9P0J0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFA13Q9P0J0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDUFA13Q9P0J0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDUFA13Q9P0J0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDUFA13Q9P0J0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDUFA13Q9P0J0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDUFA13Q9P0J0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFA13Q9P0J0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFA13Q9P0J0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFA13Q9P0J0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFA13Q9P0J0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFA13Q9P0J0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFA13Q9P0J0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFA13Q9P0J0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFA13Q9P0J0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFA13Q9P0J0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFA13Q9P0J0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFA13Q9P0J0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFA13Q9P0J0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFA13Q9P0J0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFA13Q9P0J0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFA13Q9P0J0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFA13Q9P0J0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFA13Q9P0J0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFA13Q9P0J0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFA13Q9P0J0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFA13Q9P0J0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFA13Q9P0J0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFA13Q9P0J0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFA13Q9P0J0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFA13Q9P0J0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFA13Q9P0J0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFA13Q9P0J0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFA13Q9P0J0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFA13Q9P0J0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFA13Q9P0J0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFA13Q9P0J0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFA13Q9P0J0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFA13Q9P0J0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFA13Q9P0J0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFA13Q9P0J0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFA13Q9P0J0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFA13Q9P0J0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFA13Q9P0J0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFA13Q9P0J0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFA13Q9P0J0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFA13Q9P0J0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFA13Q9P0J0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFA13Q9P0J0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFA13Q9P0J0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFA13Q9P0J0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFA13Q9P0J0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFA13Q9P0J0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFA13Q9P0J0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFA13Q9P0J0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFA13Q9P0J0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFA13Q9P0J0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFA13Q9P0J0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFA13Q9P0J0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFA13Q9P0J0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFA13Q9P0J0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFA13Q9P0J0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFA13Q9P0J0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFA13Q9P0J0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFA13Q9P0J0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFA13Q9P0J0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFA13Q9P0J0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFA13Q9P0J0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NDUFA13Q9P0J0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms