Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYOFQ9NZM1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYOFQ9NZM1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYOFQ9NZM1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYOFQ9NZM1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYOFQ9NZM1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYOFQ9NZM1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYOFQ9NZM1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYOFQ9NZM1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYOFQ9NZM1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYOFQ9NZM1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYOFQ9NZM1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYOFQ9NZM1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYOFQ9NZM1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYOFQ9NZM1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYOFQ9NZM1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYOFQ9NZM1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MYOFQ9NZM1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYOFQ9NZM1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYOFQ9NZM1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MYOFQ9NZM1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MYOFQ9NZM1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYOFQ9NZM1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MYOFQ9NZM1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MYOFQ9NZM1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MYOFQ9NZM1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYOFQ9NZM1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYOFQ9NZM1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYOFQ9NZM1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYOFQ9NZM1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYOFQ9NZM1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYOFQ9NZM1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYOFQ9NZM1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYOFQ9NZM1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYOFQ9NZM1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYOFQ9NZM1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYOFQ9NZM1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYOFQ9NZM1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYOFQ9NZM1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYOFQ9NZM1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYOFQ9NZM1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYOFQ9NZM1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYOFQ9NZM1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYOFQ9NZM1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYOFQ9NZM1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYOFQ9NZM1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MYOFQ9NZM1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MYOFQ9NZM1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MYOFQ9NZM1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MYOFQ9NZM1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYOFQ9NZM1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYOFQ9NZM1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYOFQ9NZM1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYOFQ9NZM1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYOFQ9NZM1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYOFQ9NZM1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MYOFQ9NZM1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYOFQ9NZM1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYOFQ9NZM1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYOFQ9NZM1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYOFQ9NZM1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYOFQ9NZM1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYOFQ9NZM1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYOFQ9NZM1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYOFQ9NZM1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYOFQ9NZM1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYOFQ9NZM1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYOFQ9NZM1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYOFQ9NZM1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYOFQ9NZM1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYOFQ9NZM1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYOFQ9NZM1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms