Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GDE1Q9NZC3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GDE1Q9NZC3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GDE1Q9NZC3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GDE1Q9NZC3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GDE1Q9NZC3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GDE1Q9NZC3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GDE1Q9NZC3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GDE1Q9NZC3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GDE1Q9NZC3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GDE1Q9NZC3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GDE1Q9NZC3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GDE1Q9NZC3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GDE1Q9NZC3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
GDE1Q9NZC3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GDE1Q9NZC3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GDE1Q9NZC3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GDE1Q9NZC3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GDE1Q9NZC3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GDE1Q9NZC3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GDE1Q9NZC3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GDE1Q9NZC3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GDE1Q9NZC3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GDE1Q9NZC3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GDE1Q9NZC3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GDE1Q9NZC3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms