Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ08

ERAP1, Endoplasmic reticulum aminopeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERAP1Q9NZ08 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERAP1Q9NZ08 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERAP1Q9NZ08 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERAP1Q9NZ08 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERAP1Q9NZ08 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERAP1Q9NZ08 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERAP1Q9NZ08 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERAP1Q9NZ08 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERAP1Q9NZ08 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERAP1Q9NZ08 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERAP1Q9NZ08 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ERAP1Q9NZ08 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERAP1Q9NZ08 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERAP1Q9NZ08 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERAP1Q9NZ08 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERAP1Q9NZ08 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
ERAP1Q9NZ08 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERAP1Q9NZ08 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERAP1Q9NZ08 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERAP1Q9NZ08 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERAP1Q9NZ08 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERAP1Q9NZ08 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ERAP1Q9NZ08 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERAP1Q9NZ08 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERAP1Q9NZ08 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERAP1Q9NZ08 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERAP1Q9NZ08 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERAP1Q9NZ08 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERAP1Q9NZ08 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERAP1Q9NZ08 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERAP1Q9NZ08 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERAP1Q9NZ08 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERAP1Q9NZ08 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ERAP1Q9NZ08 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERAP1Q9NZ08 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERAP1Q9NZ08 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERAP1Q9NZ08 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERAP1Q9NZ08 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERAP1Q9NZ08 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERAP1Q9NZ08 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERAP1Q9NZ08 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERAP1Q9NZ08 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERAP1Q9NZ08 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERAP1Q9NZ08 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERAP1Q9NZ08 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERAP1Q9NZ08 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERAP1Q9NZ08 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERAP1Q9NZ08 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERAP1Q9NZ08 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERAP1Q9NZ08 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERAP1Q9NZ08 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERAP1Q9NZ08 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERAP1Q9NZ08 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERAP1Q9NZ08 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERAP1Q9NZ08 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERAP1Q9NZ08 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERAP1Q9NZ08 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERAP1Q9NZ08 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERAP1Q9NZ08 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERAP1Q9NZ08 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERAP1Q9NZ08 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERAP1Q9NZ08 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERAP1Q9NZ08 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERAP1Q9NZ08 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERAP1Q9NZ08 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERAP1Q9NZ08 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERAP1Q9NZ08 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERAP1Q9NZ08 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERAP1Q9NZ08 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERAP1Q9NZ08 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERAP1Q9NZ08 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERAP1Q9NZ08 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERAP1Q9NZ08 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERAP1Q9NZ08 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERAP1Q9NZ08 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERAP1Q9NZ08 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERAP1Q9NZ08 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERAP1Q9NZ08 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ERAP1Q9NZ08 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERAP1Q9NZ08 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERAP1Q9NZ08 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERAP1Q9NZ08 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERAP1Q9NZ08 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERAP1Q9NZ08 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ERAP1Q9NZ08 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERAP1Q9NZ08 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERAP1Q9NZ08 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERAP1Q9NZ08 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERAP1Q9NZ08 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERAP1Q9NZ08 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERAP1Q9NZ08 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERAP1Q9NZ08 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERAP1Q9NZ08 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERAP1Q9NZ08 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERAP1Q9NZ08 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERAP1Q9NZ08 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERAP1Q9NZ08 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERAP1Q9NZ08 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERAP1Q9NZ08 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERAP1Q9NZ08 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms