Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM53CQ9NYF3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM53CQ9NYF3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM53CQ9NYF3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM53CQ9NYF3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM53CQ9NYF3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM53CQ9NYF3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM53CQ9NYF3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM53CQ9NYF3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM53CQ9NYF3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM53CQ9NYF3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM53CQ9NYF3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM53CQ9NYF3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM53CQ9NYF3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM53CQ9NYF3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM53CQ9NYF3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM53CQ9NYF3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM53CQ9NYF3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM53CQ9NYF3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM53CQ9NYF3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM53CQ9NYF3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM53CQ9NYF3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM53CQ9NYF3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM53CQ9NYF3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM53CQ9NYF3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FAM53CQ9NYF3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM53CQ9NYF3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM53CQ9NYF3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM53CQ9NYF3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM53CQ9NYF3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM53CQ9NYF3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM53CQ9NYF3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM53CQ9NYF3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM53CQ9NYF3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM53CQ9NYF3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM53CQ9NYF3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM53CQ9NYF3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM53CQ9NYF3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM53CQ9NYF3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM53CQ9NYF3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM53CQ9NYF3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM53CQ9NYF3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM53CQ9NYF3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAM53CQ9NYF3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAM53CQ9NYF3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAM53CQ9NYF3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FAM53CQ9NYF3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM53CQ9NYF3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM53CQ9NYF3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM53CQ9NYF3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM53CQ9NYF3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM53CQ9NYF3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM53CQ9NYF3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM53CQ9NYF3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM53CQ9NYF3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM53CQ9NYF3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM53CQ9NYF3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM53CQ9NYF3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM53CQ9NYF3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM53CQ9NYF3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM53CQ9NYF3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM53CQ9NYF3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
FAM53CQ9NYF3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM53CQ9NYF3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM53CQ9NYF3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM53CQ9NYF3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM53CQ9NYF3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM53CQ9NYF3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM53CQ9NYF3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM53CQ9NYF3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM53CQ9NYF3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM53CQ9NYF3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM53CQ9NYF3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM53CQ9NYF3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM53CQ9NYF3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM53CQ9NYF3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM53CQ9NYF3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM53CQ9NYF3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM53CQ9NYF3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM53CQ9NYF3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM53CQ9NYF3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM53CQ9NYF3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM53CQ9NYF3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM53CQ9NYF3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM53CQ9NYF3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM53CQ9NYF3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM53CQ9NYF3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM53CQ9NYF3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM53CQ9NYF3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM53CQ9NYF3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM53CQ9NYF3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM53CQ9NYF3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM53CQ9NYF3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM53CQ9NYF3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM53CQ9NYF3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM53CQ9NYF3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM53CQ9NYF3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM53CQ9NYF3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM53CQ9NYF3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM53CQ9NYF3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms