Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC5A4Q9NY91 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC5A4Q9NY91 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC5A4Q9NY91 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC5A4Q9NY91 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC5A4Q9NY91 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC5A4Q9NY91 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC5A4Q9NY91 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SLC5A4Q9NY91 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SLC5A4Q9NY91 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC5A4Q9NY91 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC5A4Q9NY91 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC5A4Q9NY91 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC5A4Q9NY91 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC5A4Q9NY91 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC5A4Q9NY91 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC5A4Q9NY91 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC5A4Q9NY91 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC5A4Q9NY91 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC5A4Q9NY91 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC5A4Q9NY91 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC5A4Q9NY91 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC5A4Q9NY91 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC5A4Q9NY91 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC5A4Q9NY91 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC5A4Q9NY91 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SLC5A4Q9NY91 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC5A4Q9NY91 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC5A4Q9NY91 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC5A4Q9NY91 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC5A4Q9NY91 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC5A4Q9NY91 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC5A4Q9NY91 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC5A4Q9NY91 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC5A4Q9NY91 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC5A4Q9NY91 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC5A4Q9NY91 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC5A4Q9NY91 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC5A4Q9NY91 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC5A4Q9NY91 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC5A4Q9NY91 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC5A4Q9NY91 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC5A4Q9NY91 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC5A4Q9NY91 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC5A4Q9NY91 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC5A4Q9NY91 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC5A4Q9NY91 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC5A4Q9NY91 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC5A4Q9NY91 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC5A4Q9NY91 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC5A4Q9NY91 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC5A4Q9NY91 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC5A4Q9NY91 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC5A4Q9NY91 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC5A4Q9NY91 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC5A4Q9NY91 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC5A4Q9NY91 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC5A4Q9NY91 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC5A4Q9NY91 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC5A4Q9NY91 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC5A4Q9NY91 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC5A4Q9NY91 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC5A4Q9NY91 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC5A4Q9NY91 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC5A4Q9NY91 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC5A4Q9NY91 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC5A4Q9NY91 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC5A4Q9NY91 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC5A4Q9NY91 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC5A4Q9NY91 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC5A4Q9NY91 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC5A4Q9NY91 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC5A4Q9NY91 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC5A4Q9NY91 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC5A4Q9NY91 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC5A4Q9NY91 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC5A4Q9NY91 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC5A4Q9NY91 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC5A4Q9NY91 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC5A4Q9NY91 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC5A4Q9NY91 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC5A4Q9NY91 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC5A4Q9NY91 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC5A4Q9NY91 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC5A4Q9NY91 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC5A4Q9NY91 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC5A4Q9NY91 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC5A4Q9NY91 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC5A4Q9NY91 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC5A4Q9NY91 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC5A4Q9NY91 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC5A4Q9NY91 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC5A4Q9NY91 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC5A4Q9NY91 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC5A4Q9NY91 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC5A4Q9NY91 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC5A4Q9NY91 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SLC5A4Q9NY91 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC5A4Q9NY91 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC5A4Q9NY91 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms