Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX95

SYBU, Syntabulin, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYBUQ9NX95 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYBUQ9NX95 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYBUQ9NX95 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYBUQ9NX95 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYBUQ9NX95 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYBUQ9NX95 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYBUQ9NX95 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SYBUQ9NX95 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYBUQ9NX95 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYBUQ9NX95 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYBUQ9NX95 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYBUQ9NX95 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYBUQ9NX95 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYBUQ9NX95 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYBUQ9NX95 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYBUQ9NX95 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYBUQ9NX95 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYBUQ9NX95 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYBUQ9NX95 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYBUQ9NX95 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYBUQ9NX95 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SYBUQ9NX95 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYBUQ9NX95 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYBUQ9NX95 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYBUQ9NX95 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYBUQ9NX95 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYBUQ9NX95 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYBUQ9NX95 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYBUQ9NX95 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYBUQ9NX95 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SYBUQ9NX95 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYBUQ9NX95 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYBUQ9NX95 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYBUQ9NX95 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYBUQ9NX95 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SYBUQ9NX95 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYBUQ9NX95 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYBUQ9NX95 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYBUQ9NX95 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYBUQ9NX95 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYBUQ9NX95 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYBUQ9NX95 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYBUQ9NX95 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYBUQ9NX95 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYBUQ9NX95 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYBUQ9NX95 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYBUQ9NX95 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SYBUQ9NX95 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SYBUQ9NX95 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYBUQ9NX95 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SYBUQ9NX95 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYBUQ9NX95 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYBUQ9NX95 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYBUQ9NX95 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYBUQ9NX95 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYBUQ9NX95 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYBUQ9NX95 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYBUQ9NX95 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYBUQ9NX95 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYBUQ9NX95 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYBUQ9NX95 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYBUQ9NX95 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYBUQ9NX95 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYBUQ9NX95 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYBUQ9NX95 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYBUQ9NX95 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYBUQ9NX95 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SYBUQ9NX95 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYBUQ9NX95 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms