Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW6

NMRK1, Nicotinamide riboside kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMRK1Q9NWW6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NMRK1Q9NWW6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NMRK1Q9NWW6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NMRK1Q9NWW6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NMRK1Q9NWW6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NMRK1Q9NWW6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NMRK1Q9NWW6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NMRK1Q9NWW6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NMRK1Q9NWW6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NMRK1Q9NWW6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NMRK1Q9NWW6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NMRK1Q9NWW6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NMRK1Q9NWW6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NMRK1Q9NWW6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NMRK1Q9NWW6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NMRK1Q9NWW6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NMRK1Q9NWW6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NMRK1Q9NWW6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NMRK1Q9NWW6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NMRK1Q9NWW6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NMRK1Q9NWW6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NMRK1Q9NWW6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NMRK1Q9NWW6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NMRK1Q9NWW6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NMRK1Q9NWW6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NMRK1Q9NWW6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NMRK1Q9NWW6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NMRK1Q9NWW6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NMRK1Q9NWW6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NMRK1Q9NWW6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NMRK1Q9NWW6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NMRK1Q9NWW6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NMRK1Q9NWW6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NMRK1Q9NWW6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NMRK1Q9NWW6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NMRK1Q9NWW6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NMRK1Q9NWW6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NMRK1Q9NWW6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NMRK1Q9NWW6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NMRK1Q9NWW6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NMRK1Q9NWW6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NMRK1Q9NWW6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NMRK1Q9NWW6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NMRK1Q9NWW6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NMRK1Q9NWW6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NMRK1Q9NWW6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NMRK1Q9NWW6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NMRK1Q9NWW6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NMRK1Q9NWW6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NMRK1Q9NWW6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NMRK1Q9NWW6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NMRK1Q9NWW6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NMRK1Q9NWW6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NMRK1Q9NWW6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NMRK1Q9NWW6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NMRK1Q9NWW6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NMRK1Q9NWW6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NMRK1Q9NWW6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NMRK1Q9NWW6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NMRK1Q9NWW6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NMRK1Q9NWW6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NMRK1Q9NWW6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NMRK1Q9NWW6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NMRK1Q9NWW6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NMRK1Q9NWW6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NMRK1Q9NWW6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NMRK1Q9NWW6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NMRK1Q9NWW6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NMRK1Q9NWW6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NMRK1Q9NWW6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms