Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV79

PCMTD2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD2Q9NV79 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCMTD2Q9NV79 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PCMTD2Q9NV79 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PCMTD2Q9NV79 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PCMTD2Q9NV79 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCMTD2Q9NV79 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PCMTD2Q9NV79 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCMTD2Q9NV79 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCMTD2Q9NV79 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCMTD2Q9NV79 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCMTD2Q9NV79 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCMTD2Q9NV79 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCMTD2Q9NV79 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCMTD2Q9NV79 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCMTD2Q9NV79 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCMTD2Q9NV79 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCMTD2Q9NV79 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCMTD2Q9NV79 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCMTD2Q9NV79 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCMTD2Q9NV79 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCMTD2Q9NV79 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PCMTD2Q9NV79 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCMTD2Q9NV79 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCMTD2Q9NV79 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCMTD2Q9NV79 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCMTD2Q9NV79 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCMTD2Q9NV79 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCMTD2Q9NV79 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCMTD2Q9NV79 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCMTD2Q9NV79 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCMTD2Q9NV79 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCMTD2Q9NV79 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCMTD2Q9NV79 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCMTD2Q9NV79 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCMTD2Q9NV79 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCMTD2Q9NV79 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCMTD2Q9NV79 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCMTD2Q9NV79 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCMTD2Q9NV79 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCMTD2Q9NV79 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCMTD2Q9NV79 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCMTD2Q9NV79 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCMTD2Q9NV79 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCMTD2Q9NV79 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCMTD2Q9NV79 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCMTD2Q9NV79 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PCMTD2Q9NV79 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCMTD2Q9NV79 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCMTD2Q9NV79 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCMTD2Q9NV79 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCMTD2Q9NV79 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCMTD2Q9NV79 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCMTD2Q9NV79 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCMTD2Q9NV79 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCMTD2Q9NV79 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCMTD2Q9NV79 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCMTD2Q9NV79 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCMTD2Q9NV79 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PCMTD2Q9NV79 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PCMTD2Q9NV79 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCMTD2Q9NV79 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCMTD2Q9NV79 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms