Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPTLC3Q9NUV7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPTLC3Q9NUV7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPTLC3Q9NUV7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPTLC3Q9NUV7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPTLC3Q9NUV7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPTLC3Q9NUV7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPTLC3Q9NUV7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPTLC3Q9NUV7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPTLC3Q9NUV7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPTLC3Q9NUV7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPTLC3Q9NUV7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPTLC3Q9NUV7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SPTLC3Q9NUV7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPTLC3Q9NUV7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPTLC3Q9NUV7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPTLC3Q9NUV7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPTLC3Q9NUV7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPTLC3Q9NUV7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPTLC3Q9NUV7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPTLC3Q9NUV7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPTLC3Q9NUV7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPTLC3Q9NUV7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPTLC3Q9NUV7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPTLC3Q9NUV7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPTLC3Q9NUV7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPTLC3Q9NUV7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPTLC3Q9NUV7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPTLC3Q9NUV7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPTLC3Q9NUV7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPTLC3Q9NUV7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPTLC3Q9NUV7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPTLC3Q9NUV7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPTLC3Q9NUV7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPTLC3Q9NUV7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPTLC3Q9NUV7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPTLC3Q9NUV7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPTLC3Q9NUV7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPTLC3Q9NUV7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPTLC3Q9NUV7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPTLC3Q9NUV7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPTLC3Q9NUV7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPTLC3Q9NUV7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPTLC3Q9NUV7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPTLC3Q9NUV7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPTLC3Q9NUV7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPTLC3Q9NUV7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPTLC3Q9NUV7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SPTLC3Q9NUV7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPTLC3Q9NUV7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPTLC3Q9NUV7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPTLC3Q9NUV7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPTLC3Q9NUV7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPTLC3Q9NUV7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPTLC3Q9NUV7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPTLC3Q9NUV7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPTLC3Q9NUV7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SPTLC3Q9NUV7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPTLC3Q9NUV7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPTLC3Q9NUV7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPTLC3Q9NUV7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SPTLC3Q9NUV7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPTLC3Q9NUV7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPTLC3Q9NUV7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SPTLC3Q9NUV7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPTLC3Q9NUV7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPTLC3Q9NUV7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPTLC3Q9NUV7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPTLC3Q9NUV7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPTLC3Q9NUV7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPTLC3Q9NUV7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPTLC3Q9NUV7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPTLC3Q9NUV7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPTLC3Q9NUV7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPTLC3Q9NUV7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPTLC3Q9NUV7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPTLC3Q9NUV7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPTLC3Q9NUV7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPTLC3Q9NUV7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPTLC3Q9NUV7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SPTLC3Q9NUV7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPTLC3Q9NUV7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPTLC3Q9NUV7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPTLC3Q9NUV7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPTLC3Q9NUV7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPTLC3Q9NUV7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPTLC3Q9NUV7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPTLC3Q9NUV7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPTLC3Q9NUV7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SPTLC3Q9NUV7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SPTLC3Q9NUV7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPTLC3Q9NUV7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPTLC3Q9NUV7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPTLC3Q9NUV7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPTLC3Q9NUV7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPTLC3Q9NUV7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPTLC3Q9NUV7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPTLC3Q9NUV7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPTLC3Q9NUV7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPTLC3Q9NUV7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms