Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO8Q9NRD0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO8Q9NRD0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO8Q9NRD0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO8Q9NRD0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO8Q9NRD0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO8Q9NRD0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO8Q9NRD0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO8Q9NRD0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO8Q9NRD0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO8Q9NRD0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO8Q9NRD0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO8Q9NRD0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO8Q9NRD0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO8Q9NRD0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO8Q9NRD0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO8Q9NRD0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO8Q9NRD0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO8Q9NRD0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO8Q9NRD0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO8Q9NRD0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO8Q9NRD0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO8Q9NRD0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO8Q9NRD0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO8Q9NRD0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO8Q9NRD0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO8Q9NRD0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO8Q9NRD0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO8Q9NRD0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO8Q9NRD0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO8Q9NRD0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO8Q9NRD0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO8Q9NRD0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO8Q9NRD0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO8Q9NRD0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO8Q9NRD0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO8Q9NRD0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO8Q9NRD0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO8Q9NRD0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO8Q9NRD0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO8Q9NRD0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO8Q9NRD0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO8Q9NRD0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO8Q9NRD0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO8Q9NRD0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO8Q9NRD0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO8Q9NRD0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO8Q9NRD0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO8Q9NRD0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO8Q9NRD0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO8Q9NRD0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO8Q9NRD0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO8Q9NRD0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO8Q9NRD0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO8Q9NRD0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO8Q9NRD0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO8Q9NRD0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO8Q9NRD0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO8Q9NRD0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO8Q9NRD0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO8Q9NRD0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO8Q9NRD0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO8Q9NRD0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO8Q9NRD0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO8Q9NRD0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO8Q9NRD0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO8Q9NRD0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO8Q9NRD0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO8Q9NRD0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO8Q9NRD0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FBXO8Q9NRD0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
FBXO8Q9NRD0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO8Q9NRD0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO8Q9NRD0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO8Q9NRD0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO8Q9NRD0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO8Q9NRD0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO8Q9NRD0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO8Q9NRD0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO8Q9NRD0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO8Q9NRD0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO8Q9NRD0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO8Q9NRD0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO8Q9NRD0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO8Q9NRD0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO8Q9NRD0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO8Q9NRD0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO8Q9NRD0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO8Q9NRD0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FBXO8Q9NRD0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO8Q9NRD0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO8Q9NRD0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO8Q9NRD0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO8Q9NRD0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO8Q9NRD0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO8Q9NRD0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO8Q9NRD0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO8Q9NRD0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO8Q9NRD0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO8Q9NRD0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms