Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG3

UBN1, Ubinuclein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBN1Q9NPG3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
UBN1Q9NPG3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBN1Q9NPG3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBN1Q9NPG3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBN1Q9NPG3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBN1Q9NPG3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBN1Q9NPG3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBN1Q9NPG3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBN1Q9NPG3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBN1Q9NPG3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
UBN1Q9NPG3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBN1Q9NPG3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBN1Q9NPG3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBN1Q9NPG3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBN1Q9NPG3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBN1Q9NPG3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBN1Q9NPG3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBN1Q9NPG3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBN1Q9NPG3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
UBN1Q9NPG3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBN1Q9NPG3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBN1Q9NPG3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBN1Q9NPG3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBN1Q9NPG3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBN1Q9NPG3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBN1Q9NPG3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBN1Q9NPG3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBN1Q9NPG3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBN1Q9NPG3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBN1Q9NPG3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBN1Q9NPG3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBN1Q9NPG3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBN1Q9NPG3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
UBN1Q9NPG3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBN1Q9NPG3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBN1Q9NPG3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBN1Q9NPG3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBN1Q9NPG3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBN1Q9NPG3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBN1Q9NPG3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBN1Q9NPG3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBN1Q9NPG3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBN1Q9NPG3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBN1Q9NPG3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBN1Q9NPG3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBN1Q9NPG3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBN1Q9NPG3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBN1Q9NPG3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
UBN1Q9NPG3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBN1Q9NPG3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBN1Q9NPG3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBN1Q9NPG3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
UBN1Q9NPG3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBN1Q9NPG3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBN1Q9NPG3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBN1Q9NPG3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBN1Q9NPG3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBN1Q9NPG3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBN1Q9NPG3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBN1Q9NPG3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBN1Q9NPG3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBN1Q9NPG3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBN1Q9NPG3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBN1Q9NPG3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBN1Q9NPG3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBN1Q9NPG3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
UBN1Q9NPG3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBN1Q9NPG3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBN1Q9NPG3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBN1Q9NPG3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBN1Q9NPG3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBN1Q9NPG3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
UBN1Q9NPG3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBN1Q9NPG3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBN1Q9NPG3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBN1Q9NPG3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBN1Q9NPG3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBN1Q9NPG3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
UBN1Q9NPG3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBN1Q9NPG3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBN1Q9NPG3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBN1Q9NPG3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBN1Q9NPG3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBN1Q9NPG3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBN1Q9NPG3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBN1Q9NPG3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBN1Q9NPG3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms