Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FZD3Q9NPG1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FZD3Q9NPG1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FZD3Q9NPG1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FZD3Q9NPG1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FZD3Q9NPG1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FZD3Q9NPG1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FZD3Q9NPG1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FZD3Q9NPG1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FZD3Q9NPG1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FZD3Q9NPG1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FZD3Q9NPG1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FZD3Q9NPG1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FZD3Q9NPG1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FZD3Q9NPG1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FZD3Q9NPG1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FZD3Q9NPG1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FZD3Q9NPG1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FZD3Q9NPG1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FZD3Q9NPG1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FZD3Q9NPG1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FZD3Q9NPG1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FZD3Q9NPG1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FZD3Q9NPG1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FZD3Q9NPG1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FZD3Q9NPG1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FZD3Q9NPG1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FZD3Q9NPG1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FZD3Q9NPG1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FZD3Q9NPG1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FZD3Q9NPG1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FZD3Q9NPG1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FZD3Q9NPG1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FZD3Q9NPG1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FZD3Q9NPG1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FZD3Q9NPG1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FZD3Q9NPG1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FZD3Q9NPG1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FZD3Q9NPG1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FZD3Q9NPG1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FZD3Q9NPG1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FZD3Q9NPG1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FZD3Q9NPG1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FZD3Q9NPG1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FZD3Q9NPG1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FZD3Q9NPG1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FZD3Q9NPG1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FZD3Q9NPG1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FZD3Q9NPG1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FZD3Q9NPG1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FZD3Q9NPG1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FZD3Q9NPG1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FZD3Q9NPG1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FZD3Q9NPG1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FZD3Q9NPG1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FZD3Q9NPG1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FZD3Q9NPG1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FZD3Q9NPG1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FZD3Q9NPG1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FZD3Q9NPG1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FZD3Q9NPG1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FZD3Q9NPG1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FZD3Q9NPG1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FZD3Q9NPG1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FZD3Q9NPG1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FZD3Q9NPG1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FZD3Q9NPG1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FZD3Q9NPG1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FZD3Q9NPG1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FZD3Q9NPG1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FZD3Q9NPG1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FZD3Q9NPG1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FZD3Q9NPG1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FZD3Q9NPG1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FZD3Q9NPG1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FZD3Q9NPG1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FZD3Q9NPG1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FZD3Q9NPG1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FZD3Q9NPG1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FZD3Q9NPG1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FZD3Q9NPG1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FZD3Q9NPG1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FZD3Q9NPG1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FZD3Q9NPG1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FZD3Q9NPG1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FZD3Q9NPG1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FZD3Q9NPG1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FZD3Q9NPG1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FZD3Q9NPG1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FZD3Q9NPG1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FZD3Q9NPG1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FZD3Q9NPG1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FZD3Q9NPG1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FZD3Q9NPG1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FZD3Q9NPG1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FZD3Q9NPG1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FZD3Q9NPG1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FZD3Q9NPG1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FZD3Q9NPG1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FZD3Q9NPG1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms