Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC1

LTB4R2, Leukotriene B4 receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB4R2Q9NPC1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LTB4R2Q9NPC1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LTB4R2Q9NPC1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LTB4R2Q9NPC1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LTB4R2Q9NPC1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LTB4R2Q9NPC1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LTB4R2Q9NPC1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTB4R2Q9NPC1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LTB4R2Q9NPC1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTB4R2Q9NPC1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTB4R2Q9NPC1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTB4R2Q9NPC1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LTB4R2Q9NPC1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTB4R2Q9NPC1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTB4R2Q9NPC1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTB4R2Q9NPC1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTB4R2Q9NPC1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTB4R2Q9NPC1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTB4R2Q9NPC1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTB4R2Q9NPC1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTB4R2Q9NPC1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTB4R2Q9NPC1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTB4R2Q9NPC1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTB4R2Q9NPC1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTB4R2Q9NPC1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTB4R2Q9NPC1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTB4R2Q9NPC1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTB4R2Q9NPC1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTB4R2Q9NPC1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTB4R2Q9NPC1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTB4R2Q9NPC1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTB4R2Q9NPC1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTB4R2Q9NPC1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTB4R2Q9NPC1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTB4R2Q9NPC1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTB4R2Q9NPC1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTB4R2Q9NPC1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTB4R2Q9NPC1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LTB4R2Q9NPC1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTB4R2Q9NPC1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTB4R2Q9NPC1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTB4R2Q9NPC1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTB4R2Q9NPC1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTB4R2Q9NPC1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTB4R2Q9NPC1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTB4R2Q9NPC1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTB4R2Q9NPC1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTB4R2Q9NPC1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTB4R2Q9NPC1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTB4R2Q9NPC1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTB4R2Q9NPC1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LTB4R2Q9NPC1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LTB4R2Q9NPC1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTB4R2Q9NPC1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTB4R2Q9NPC1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTB4R2Q9NPC1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LTB4R2Q9NPC1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LTB4R2Q9NPC1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTB4R2Q9NPC1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTB4R2Q9NPC1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTB4R2Q9NPC1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTB4R2Q9NPC1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTB4R2Q9NPC1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTB4R2Q9NPC1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTB4R2Q9NPC1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTB4R2Q9NPC1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTB4R2Q9NPC1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTB4R2Q9NPC1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTB4R2Q9NPC1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LTB4R2Q9NPC1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LTB4R2Q9NPC1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LTB4R2Q9NPC1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTB4R2Q9NPC1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTB4R2Q9NPC1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LTB4R2Q9NPC1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTB4R2Q9NPC1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTB4R2Q9NPC1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LTB4R2Q9NPC1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTB4R2Q9NPC1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTB4R2Q9NPC1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTB4R2Q9NPC1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTB4R2Q9NPC1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTB4R2Q9NPC1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTB4R2Q9NPC1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTB4R2Q9NPC1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LTB4R2Q9NPC1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTB4R2Q9NPC1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTB4R2Q9NPC1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTB4R2Q9NPC1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTB4R2Q9NPC1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTB4R2Q9NPC1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTB4R2Q9NPC1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTB4R2Q9NPC1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTB4R2Q9NPC1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTB4R2Q9NPC1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTB4R2Q9NPC1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LTB4R2Q9NPC1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTB4R2Q9NPC1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTB4R2Q9NPC1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTB4R2Q9NPC1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms