Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCX4

TRPC7, Short transient receptor potential channel 7, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC7Q9HCX4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRPC7Q9HCX4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRPC7Q9HCX4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRPC7Q9HCX4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
TRPC7Q9HCX4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRPC7Q9HCX4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRPC7Q9HCX4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TRPC7Q9HCX4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TRPC7Q9HCX4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRPC7Q9HCX4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRPC7Q9HCX4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRPC7Q9HCX4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRPC7Q9HCX4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRPC7Q9HCX4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRPC7Q9HCX4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRPC7Q9HCX4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRPC7Q9HCX4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRPC7Q9HCX4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRPC7Q9HCX4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRPC7Q9HCX4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRPC7Q9HCX4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRPC7Q9HCX4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRPC7Q9HCX4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRPC7Q9HCX4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRPC7Q9HCX4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRPC7Q9HCX4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRPC7Q9HCX4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRPC7Q9HCX4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRPC7Q9HCX4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRPC7Q9HCX4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRPC7Q9HCX4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPC7Q9HCX4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPC7Q9HCX4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPC7Q9HCX4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPC7Q9HCX4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPC7Q9HCX4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPC7Q9HCX4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRPC7Q9HCX4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRPC7Q9HCX4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRPC7Q9HCX4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TRPC7Q9HCX4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPC7Q9HCX4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPC7Q9HCX4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPC7Q9HCX4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPC7Q9HCX4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRPC7Q9HCX4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPC7Q9HCX4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPC7Q9HCX4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPC7Q9HCX4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPC7Q9HCX4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPC7Q9HCX4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPC7Q9HCX4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPC7Q9HCX4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPC7Q9HCX4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPC7Q9HCX4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPC7Q9HCX4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPC7Q9HCX4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPC7Q9HCX4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPC7Q9HCX4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPC7Q9HCX4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPC7Q9HCX4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPC7Q9HCX4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPC7Q9HCX4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TRPC7Q9HCX4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRPC7Q9HCX4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRPC7Q9HCX4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRPC7Q9HCX4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRPC7Q9HCX4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRPC7Q9HCX4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms