Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CBX8Q9HC52 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CBX8Q9HC52 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CBX8Q9HC52 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CBX8Q9HC52 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CBX8Q9HC52 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CBX8Q9HC52 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CBX8Q9HC52 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CBX8Q9HC52 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CBX8Q9HC52 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CBX8Q9HC52 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CBX8Q9HC52 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CBX8Q9HC52 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CBX8Q9HC52 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CBX8Q9HC52 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CBX8Q9HC52 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CBX8Q9HC52 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CBX8Q9HC52 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CBX8Q9HC52 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CBX8Q9HC52 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CBX8Q9HC52 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CBX8Q9HC52 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CBX8Q9HC52 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CBX8Q9HC52 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CBX8Q9HC52 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CBX8Q9HC52 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CBX8Q9HC52 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CBX8Q9HC52 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CBX8Q9HC52 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CBX8Q9HC52 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CBX8Q9HC52 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CBX8Q9HC52 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CBX8Q9HC52 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CBX8Q9HC52 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CBX8Q9HC52 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CBX8Q9HC52 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CBX8Q9HC52 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CBX8Q9HC52 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CBX8Q9HC52 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CBX8Q9HC52 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CBX8Q9HC52 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CBX8Q9HC52 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CBX8Q9HC52 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CBX8Q9HC52 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CBX8Q9HC52 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CBX8Q9HC52 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CBX8Q9HC52 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CBX8Q9HC52 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CBX8Q9HC52 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CBX8Q9HC52 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CBX8Q9HC52 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CBX8Q9HC52 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CBX8Q9HC52 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CBX8Q9HC52 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CBX8Q9HC52 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CBX8Q9HC52 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CBX8Q9HC52 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CBX8Q9HC52 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CBX8Q9HC52 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CBX8Q9HC52 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CBX8Q9HC52 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CBX8Q9HC52 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CBX8Q9HC52 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CBX8Q9HC52 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CBX8Q9HC52 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CBX8Q9HC52 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CBX8Q9HC52 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CBX8Q9HC52 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CBX8Q9HC52 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CBX8Q9HC52 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CBX8Q9HC52 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CBX8Q9HC52 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CBX8Q9HC52 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CBX8Q9HC52 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CBX8Q9HC52 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CBX8Q9HC52 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CBX8Q9HC52 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CBX8Q9HC52 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CBX8Q9HC52 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CBX8Q9HC52 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CBX8Q9HC52 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CBX8Q9HC52 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CBX8Q9HC52 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CBX8Q9HC52 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CBX8Q9HC52 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CBX8Q9HC52 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CBX8Q9HC52 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CBX8Q9HC52 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CBX8Q9HC52 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CBX8Q9HC52 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CBX8Q9HC52 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CBX8Q9HC52 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CBX8Q9HC52 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CBX8Q9HC52 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CBX8Q9HC52 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CBX8Q9HC52 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CBX8Q9HC52 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CBX8Q9HC52 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CBX8Q9HC52 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CBX8Q9HC52 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms