Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIN28AQ9H9Z2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIN28AQ9H9Z2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LIN28AQ9H9Z2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIN28AQ9H9Z2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIN28AQ9H9Z2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIN28AQ9H9Z2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIN28AQ9H9Z2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIN28AQ9H9Z2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIN28AQ9H9Z2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN28AQ9H9Z2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN28AQ9H9Z2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN28AQ9H9Z2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIN28AQ9H9Z2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIN28AQ9H9Z2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIN28AQ9H9Z2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIN28AQ9H9Z2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIN28AQ9H9Z2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIN28AQ9H9Z2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LIN28AQ9H9Z2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIN28AQ9H9Z2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIN28AQ9H9Z2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIN28AQ9H9Z2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN28AQ9H9Z2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN28AQ9H9Z2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN28AQ9H9Z2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIN28AQ9H9Z2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIN28AQ9H9Z2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIN28AQ9H9Z2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIN28AQ9H9Z2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIN28AQ9H9Z2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LIN28AQ9H9Z2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIN28AQ9H9Z2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIN28AQ9H9Z2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIN28AQ9H9Z2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIN28AQ9H9Z2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIN28AQ9H9Z2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LIN28AQ9H9Z2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIN28AQ9H9Z2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIN28AQ9H9Z2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIN28AQ9H9Z2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIN28AQ9H9Z2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIN28AQ9H9Z2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN28AQ9H9Z2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN28AQ9H9Z2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN28AQ9H9Z2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN28AQ9H9Z2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN28AQ9H9Z2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN28AQ9H9Z2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN28AQ9H9Z2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIN28AQ9H9Z2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIN28AQ9H9Z2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIN28AQ9H9Z2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIN28AQ9H9Z2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms