Protein–RNA interactions for Protein: Q9H902

REEP1, Receptor expression-enhancing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP1Q9H902 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
REEP1Q9H902 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
REEP1Q9H902 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REEP1Q9H902 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REEP1Q9H902 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REEP1Q9H902 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
REEP1Q9H902 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REEP1Q9H902 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
REEP1Q9H902 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
REEP1Q9H902 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
REEP1Q9H902 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
REEP1Q9H902 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
REEP1Q9H902 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
REEP1Q9H902 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
REEP1Q9H902 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
REEP1Q9H902 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
REEP1Q9H902 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REEP1Q9H902 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REEP1Q9H902 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REEP1Q9H902 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REEP1Q9H902 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
REEP1Q9H902 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REEP1Q9H902 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
REEP1Q9H902 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
REEP1Q9H902 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
REEP1Q9H902 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
REEP1Q9H902 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
REEP1Q9H902 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
REEP1Q9H902 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
REEP1Q9H902 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
REEP1Q9H902 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
REEP1Q9H902 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
REEP1Q9H902 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
REEP1Q9H902 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
REEP1Q9H902 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
REEP1Q9H902 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
REEP1Q9H902 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
REEP1Q9H902 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
REEP1Q9H902 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms