Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8W3

FAM204A, Protein FAM204A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM204AQ9H8W3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM204AQ9H8W3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM204AQ9H8W3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM204AQ9H8W3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FAM204AQ9H8W3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM204AQ9H8W3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM204AQ9H8W3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM204AQ9H8W3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM204AQ9H8W3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM204AQ9H8W3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM204AQ9H8W3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM204AQ9H8W3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM204AQ9H8W3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM204AQ9H8W3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM204AQ9H8W3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM204AQ9H8W3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM204AQ9H8W3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM204AQ9H8W3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM204AQ9H8W3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM204AQ9H8W3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM204AQ9H8W3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM204AQ9H8W3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM204AQ9H8W3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM204AQ9H8W3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM204AQ9H8W3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM204AQ9H8W3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM204AQ9H8W3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM204AQ9H8W3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM204AQ9H8W3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM204AQ9H8W3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM204AQ9H8W3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM204AQ9H8W3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM204AQ9H8W3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM204AQ9H8W3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM204AQ9H8W3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM204AQ9H8W3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM204AQ9H8W3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM204AQ9H8W3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM204AQ9H8W3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM204AQ9H8W3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM204AQ9H8W3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM204AQ9H8W3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM204AQ9H8W3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM204AQ9H8W3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM204AQ9H8W3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM204AQ9H8W3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM204AQ9H8W3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM204AQ9H8W3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM204AQ9H8W3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM204AQ9H8W3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM204AQ9H8W3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM204AQ9H8W3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM204AQ9H8W3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM204AQ9H8W3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM204AQ9H8W3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM204AQ9H8W3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM204AQ9H8W3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM204AQ9H8W3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FAM204AQ9H8W3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FAM204AQ9H8W3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM204AQ9H8W3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM204AQ9H8W3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM204AQ9H8W3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM204AQ9H8W3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM204AQ9H8W3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM204AQ9H8W3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM204AQ9H8W3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM204AQ9H8W3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM204AQ9H8W3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM204AQ9H8W3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM204AQ9H8W3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM204AQ9H8W3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM204AQ9H8W3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM204AQ9H8W3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM204AQ9H8W3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM204AQ9H8W3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM204AQ9H8W3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM204AQ9H8W3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM204AQ9H8W3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM204AQ9H8W3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FAM204AQ9H8W3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FAM204AQ9H8W3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM204AQ9H8W3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM204AQ9H8W3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM204AQ9H8W3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM204AQ9H8W3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM204AQ9H8W3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM204AQ9H8W3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM204AQ9H8W3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM204AQ9H8W3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM204AQ9H8W3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM204AQ9H8W3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM204AQ9H8W3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM204AQ9H8W3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM204AQ9H8W3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM204AQ9H8W3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM204AQ9H8W3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM204AQ9H8W3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM204AQ9H8W3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM204AQ9H8W3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms