Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRABDQ9H4I3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRABDQ9H4I3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRABDQ9H4I3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRABDQ9H4I3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRABDQ9H4I3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRABDQ9H4I3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRABDQ9H4I3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRABDQ9H4I3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRABDQ9H4I3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRABDQ9H4I3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRABDQ9H4I3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRABDQ9H4I3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRABDQ9H4I3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRABDQ9H4I3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRABDQ9H4I3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRABDQ9H4I3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRABDQ9H4I3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRABDQ9H4I3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRABDQ9H4I3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRABDQ9H4I3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRABDQ9H4I3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRABDQ9H4I3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRABDQ9H4I3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRABDQ9H4I3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRABDQ9H4I3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRABDQ9H4I3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRABDQ9H4I3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRABDQ9H4I3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRABDQ9H4I3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRABDQ9H4I3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRABDQ9H4I3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRABDQ9H4I3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRABDQ9H4I3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRABDQ9H4I3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRABDQ9H4I3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRABDQ9H4I3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRABDQ9H4I3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRABDQ9H4I3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRABDQ9H4I3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRABDQ9H4I3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRABDQ9H4I3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRABDQ9H4I3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRABDQ9H4I3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRABDQ9H4I3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRABDQ9H4I3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRABDQ9H4I3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRABDQ9H4I3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRABDQ9H4I3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRABDQ9H4I3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRABDQ9H4I3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRABDQ9H4I3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRABDQ9H4I3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRABDQ9H4I3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRABDQ9H4I3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRABDQ9H4I3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRABDQ9H4I3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRABDQ9H4I3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRABDQ9H4I3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRABDQ9H4I3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
TRABDQ9H4I3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRABDQ9H4I3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRABDQ9H4I3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRABDQ9H4I3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRABDQ9H4I3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRABDQ9H4I3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRABDQ9H4I3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRABDQ9H4I3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRABDQ9H4I3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRABDQ9H4I3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRABDQ9H4I3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms