Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C0

GAN, Gigaxonin, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GANQ9H2C0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GANQ9H2C0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GANQ9H2C0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GANQ9H2C0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GANQ9H2C0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GANQ9H2C0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GANQ9H2C0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GANQ9H2C0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GANQ9H2C0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GANQ9H2C0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GANQ9H2C0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GANQ9H2C0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GANQ9H2C0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GANQ9H2C0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GANQ9H2C0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GANQ9H2C0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GANQ9H2C0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GANQ9H2C0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GANQ9H2C0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GANQ9H2C0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GANQ9H2C0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GANQ9H2C0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GANQ9H2C0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GANQ9H2C0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GANQ9H2C0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GANQ9H2C0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GANQ9H2C0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GANQ9H2C0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GANQ9H2C0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GANQ9H2C0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GANQ9H2C0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GANQ9H2C0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GANQ9H2C0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GANQ9H2C0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GANQ9H2C0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GANQ9H2C0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GANQ9H2C0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GANQ9H2C0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GANQ9H2C0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GANQ9H2C0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GANQ9H2C0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GANQ9H2C0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GANQ9H2C0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GANQ9H2C0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GANQ9H2C0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GANQ9H2C0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GANQ9H2C0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GANQ9H2C0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GANQ9H2C0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GANQ9H2C0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GANQ9H2C0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GANQ9H2C0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GANQ9H2C0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GANQ9H2C0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GANQ9H2C0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GANQ9H2C0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GANQ9H2C0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GANQ9H2C0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GANQ9H2C0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GANQ9H2C0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GANQ9H2C0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GANQ9H2C0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GANQ9H2C0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GANQ9H2C0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GANQ9H2C0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GANQ9H2C0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
GANQ9H2C0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GANQ9H2C0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GANQ9H2C0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GANQ9H2C0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GANQ9H2C0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GANQ9H2C0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GANQ9H2C0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GANQ9H2C0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GANQ9H2C0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GANQ9H2C0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
GANQ9H2C0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GANQ9H2C0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GANQ9H2C0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GANQ9H2C0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GANQ9H2C0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GANQ9H2C0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GANQ9H2C0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GANQ9H2C0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GANQ9H2C0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GANQ9H2C0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GANQ9H2C0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GANQ9H2C0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GANQ9H2C0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GANQ9H2C0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GANQ9H2C0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GANQ9H2C0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GANQ9H2C0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GANQ9H2C0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GANQ9H2C0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GANQ9H2C0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GANQ9H2C0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GANQ9H2C0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GANQ9H2C0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GANQ9H2C0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms