Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM7Q9C029 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM7Q9C029 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM7Q9C029 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM7Q9C029 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM7Q9C029 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM7Q9C029 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM7Q9C029 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM7Q9C029 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM7Q9C029 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM7Q9C029 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM7Q9C029 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM7Q9C029 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM7Q9C029 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM7Q9C029 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM7Q9C029 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM7Q9C029 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM7Q9C029 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM7Q9C029 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM7Q9C029 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM7Q9C029 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM7Q9C029 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM7Q9C029 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM7Q9C029 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM7Q9C029 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM7Q9C029 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM7Q9C029 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM7Q9C029 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM7Q9C029 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM7Q9C029 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM7Q9C029 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM7Q9C029 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM7Q9C029 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM7Q9C029 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM7Q9C029 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM7Q9C029 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM7Q9C029 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRIM7Q9C029 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRIM7Q9C029 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM7Q9C029 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM7Q9C029 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM7Q9C029 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM7Q9C029 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM7Q9C029 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM7Q9C029 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM7Q9C029 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM7Q9C029 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM7Q9C029 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM7Q9C029 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM7Q9C029 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM7Q9C029 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM7Q9C029 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM7Q9C029 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM7Q9C029 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM7Q9C029 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM7Q9C029 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM7Q9C029 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM7Q9C029 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM7Q9C029 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM7Q9C029 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM7Q9C029 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM7Q9C029 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM7Q9C029 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM7Q9C029 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM7Q9C029 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM7Q9C029 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM7Q9C029 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM7Q9C029 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM7Q9C029 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM7Q9C029 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM7Q9C029 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM7Q9C029 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM7Q9C029 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM7Q9C029 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM7Q9C029 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM7Q9C029 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM7Q9C029 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM7Q9C029 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM7Q9C029 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM7Q9C029 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM7Q9C029 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM7Q9C029 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM7Q9C029 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM7Q9C029 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM7Q9C029 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM7Q9C029 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM7Q9C029 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM7Q9C029 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM7Q9C029 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM7Q9C029 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM7Q9C029 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM7Q9C029 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM7Q9C029 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM7Q9C029 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM7Q9C029 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM7Q9C029 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM7Q9C029 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms