Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM31Q9BZY9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM31Q9BZY9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM31Q9BZY9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM31Q9BZY9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM31Q9BZY9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM31Q9BZY9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM31Q9BZY9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM31Q9BZY9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM31Q9BZY9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM31Q9BZY9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM31Q9BZY9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM31Q9BZY9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM31Q9BZY9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM31Q9BZY9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM31Q9BZY9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM31Q9BZY9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM31Q9BZY9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM31Q9BZY9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM31Q9BZY9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM31Q9BZY9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM31Q9BZY9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM31Q9BZY9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM31Q9BZY9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM31Q9BZY9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM31Q9BZY9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM31Q9BZY9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM31Q9BZY9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM31Q9BZY9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM31Q9BZY9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM31Q9BZY9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM31Q9BZY9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM31Q9BZY9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM31Q9BZY9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM31Q9BZY9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM31Q9BZY9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM31Q9BZY9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM31Q9BZY9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM31Q9BZY9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM31Q9BZY9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM31Q9BZY9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM31Q9BZY9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM31Q9BZY9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM31Q9BZY9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM31Q9BZY9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM31Q9BZY9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM31Q9BZY9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM31Q9BZY9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM31Q9BZY9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM31Q9BZY9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM31Q9BZY9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM31Q9BZY9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM31Q9BZY9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM31Q9BZY9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM31Q9BZY9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM31Q9BZY9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM31Q9BZY9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM31Q9BZY9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM31Q9BZY9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM31Q9BZY9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM31Q9BZY9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM31Q9BZY9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM31Q9BZY9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM31Q9BZY9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM31Q9BZY9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM31Q9BZY9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM31Q9BZY9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM31Q9BZY9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM31Q9BZY9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM31Q9BZY9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM31Q9BZY9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM31Q9BZY9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms