Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ROPN1BQ9BZX4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ROPN1BQ9BZX4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ROPN1BQ9BZX4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ROPN1BQ9BZX4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ROPN1BQ9BZX4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ROPN1BQ9BZX4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ROPN1BQ9BZX4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ROPN1BQ9BZX4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ROPN1BQ9BZX4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ROPN1BQ9BZX4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ROPN1BQ9BZX4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ROPN1BQ9BZX4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ROPN1BQ9BZX4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ROPN1BQ9BZX4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ROPN1BQ9BZX4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ROPN1BQ9BZX4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ROPN1BQ9BZX4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ROPN1BQ9BZX4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ROPN1BQ9BZX4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ROPN1BQ9BZX4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ROPN1BQ9BZX4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ROPN1BQ9BZX4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ROPN1BQ9BZX4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ROPN1BQ9BZX4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ROPN1BQ9BZX4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ROPN1BQ9BZX4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ROPN1BQ9BZX4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ROPN1BQ9BZX4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ROPN1BQ9BZX4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ROPN1BQ9BZX4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ROPN1BQ9BZX4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ROPN1BQ9BZX4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ROPN1BQ9BZX4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ROPN1BQ9BZX4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ROPN1BQ9BZX4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ROPN1BQ9BZX4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ROPN1BQ9BZX4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ROPN1BQ9BZX4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ROPN1BQ9BZX4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ROPN1BQ9BZX4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ROPN1BQ9BZX4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ROPN1BQ9BZX4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ROPN1BQ9BZX4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ROPN1BQ9BZX4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ROPN1BQ9BZX4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ROPN1BQ9BZX4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ROPN1BQ9BZX4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ROPN1BQ9BZX4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ROPN1BQ9BZX4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ROPN1BQ9BZX4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
ROPN1BQ9BZX4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ROPN1BQ9BZX4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ROPN1BQ9BZX4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ROPN1BQ9BZX4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ROPN1BQ9BZX4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ROPN1BQ9BZX4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ROPN1BQ9BZX4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ROPN1BQ9BZX4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ROPN1BQ9BZX4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ROPN1BQ9BZX4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ROPN1BQ9BZX4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ROPN1BQ9BZX4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ROPN1BQ9BZX4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ROPN1BQ9BZX4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ROPN1BQ9BZX4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ROPN1BQ9BZX4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ROPN1BQ9BZX4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ROPN1BQ9BZX4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ROPN1BQ9BZX4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ROPN1BQ9BZX4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ROPN1BQ9BZX4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ROPN1BQ9BZX4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ROPN1BQ9BZX4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ROPN1BQ9BZX4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ROPN1BQ9BZX4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ROPN1BQ9BZX4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ROPN1BQ9BZX4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ROPN1BQ9BZX4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ROPN1BQ9BZX4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ROPN1BQ9BZX4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ROPN1BQ9BZX4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ROPN1BQ9BZX4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ROPN1BQ9BZX4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ROPN1BQ9BZX4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ROPN1BQ9BZX4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ROPN1BQ9BZX4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ROPN1BQ9BZX4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ROPN1BQ9BZX4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ROPN1BQ9BZX4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ROPN1BQ9BZX4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ROPN1BQ9BZX4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ROPN1BQ9BZX4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ROPN1BQ9BZX4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ROPN1BQ9BZX4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ROPN1BQ9BZX4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ROPN1BQ9BZX4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ROPN1BQ9BZX4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms