Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
KDM5DQ9BY66 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.67■■■■□ 3.78
KDM5DQ9BY66 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
KDM5DQ9BY66 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
KDM5DQ9BY66 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
KDM5DQ9BY66 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
KDM5DQ9BY66 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
KDM5DQ9BY66 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
KDM5DQ9BY66 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
KDM5DQ9BY66 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC38.61■■■■□ 3.77
KDM5DQ9BY66 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
KDM5DQ9BY66 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
KDM5DQ9BY66 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
KDM5DQ9BY66 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
KDM5DQ9BY66 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
KDM5DQ9BY66 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
KDM5DQ9BY66 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
KDM5DQ9BY66 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
KDM5DQ9BY66 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC38.57■■■■□ 3.77
KDM5DQ9BY66 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
KDM5DQ9BY66 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
KDM5DQ9BY66 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
KDM5DQ9BY66 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
KDM5DQ9BY66 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
KDM5DQ9BY66 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
KDM5DQ9BY66 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
KDM5DQ9BY66 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
KDM5DQ9BY66 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
KDM5DQ9BY66 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
KDM5DQ9BY66 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
KDM5DQ9BY66 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
KDM5DQ9BY66 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
KDM5DQ9BY66 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
KDM5DQ9BY66 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
KDM5DQ9BY66 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
KDM5DQ9BY66 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
KDM5DQ9BY66 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
KDM5DQ9BY66 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
KDM5DQ9BY66 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.48■■■■□ 3.75
KDM5DQ9BY66 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
KDM5DQ9BY66 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
KDM5DQ9BY66 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
KDM5DQ9BY66 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
KDM5DQ9BY66 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
KDM5DQ9BY66 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
KDM5DQ9BY66 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
KDM5DQ9BY66 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
KDM5DQ9BY66 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
KDM5DQ9BY66 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
KDM5DQ9BY66 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
KDM5DQ9BY66 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
KDM5DQ9BY66 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
KDM5DQ9BY66 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
KDM5DQ9BY66 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
KDM5DQ9BY66 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
KDM5DQ9BY66 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
KDM5DQ9BY66 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
KDM5DQ9BY66 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
KDM5DQ9BY66 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
KDM5DQ9BY66 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
KDM5DQ9BY66 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
KDM5DQ9BY66 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC38.38■■■■□ 3.73
KDM5DQ9BY66 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
KDM5DQ9BY66 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
KDM5DQ9BY66 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
KDM5DQ9BY66 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
KDM5DQ9BY66 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
KDM5DQ9BY66 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
KDM5DQ9BY66 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
KDM5DQ9BY66 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
KDM5DQ9BY66 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
KDM5DQ9BY66 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
KDM5DQ9BY66 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
KDM5DQ9BY66 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
KDM5DQ9BY66 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
KDM5DQ9BY66 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
KDM5DQ9BY66 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
KDM5DQ9BY66 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
KDM5DQ9BY66 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
KDM5DQ9BY66 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
KDM5DQ9BY66 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
KDM5DQ9BY66 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
KDM5DQ9BY66 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
KDM5DQ9BY66 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
KDM5DQ9BY66 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
KDM5DQ9BY66 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
KDM5DQ9BY66 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
KDM5DQ9BY66 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
KDM5DQ9BY66 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
KDM5DQ9BY66 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
KDM5DQ9BY66 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
KDM5DQ9BY66 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
KDM5DQ9BY66 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
KDM5DQ9BY66 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
KDM5DQ9BY66 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC38.22■■■■□ 3.71
KDM5DQ9BY66 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
KDM5DQ9BY66 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
KDM5DQ9BY66 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
KDM5DQ9BY66 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
KDM5DQ9BY66 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms