Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms