Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA4Q9BXL8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA4Q9BXL8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA4Q9BXL8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA4Q9BXL8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA4Q9BXL8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA4Q9BXL8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA4Q9BXL8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA4Q9BXL8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA4Q9BXL8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA4Q9BXL8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA4Q9BXL8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA4Q9BXL8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA4Q9BXL8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA4Q9BXL8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA4Q9BXL8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA4Q9BXL8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDCA4Q9BXL8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDCA4Q9BXL8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDCA4Q9BXL8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDCA4Q9BXL8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDCA4Q9BXL8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA4Q9BXL8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA4Q9BXL8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA4Q9BXL8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA4Q9BXL8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA4Q9BXL8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA4Q9BXL8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA4Q9BXL8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA4Q9BXL8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA4Q9BXL8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA4Q9BXL8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA4Q9BXL8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA4Q9BXL8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA4Q9BXL8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA4Q9BXL8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA4Q9BXL8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA4Q9BXL8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA4Q9BXL8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA4Q9BXL8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA4Q9BXL8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA4Q9BXL8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA4Q9BXL8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA4Q9BXL8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA4Q9BXL8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA4Q9BXL8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA4Q9BXL8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA4Q9BXL8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA4Q9BXL8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA4Q9BXL8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA4Q9BXL8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA4Q9BXL8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDCA4Q9BXL8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDCA4Q9BXL8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDCA4Q9BXL8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDCA4Q9BXL8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA4Q9BXL8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDCA4Q9BXL8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDCA4Q9BXL8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA4Q9BXL8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA4Q9BXL8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA4Q9BXL8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA4Q9BXL8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA4Q9BXL8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA4Q9BXL8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA4Q9BXL8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms