Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM43Q9BTV4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM43Q9BTV4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM43Q9BTV4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM43Q9BTV4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM43Q9BTV4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM43Q9BTV4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM43Q9BTV4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM43Q9BTV4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM43Q9BTV4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM43Q9BTV4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM43Q9BTV4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM43Q9BTV4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM43Q9BTV4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM43Q9BTV4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM43Q9BTV4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM43Q9BTV4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM43Q9BTV4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM43Q9BTV4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM43Q9BTV4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM43Q9BTV4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM43Q9BTV4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM43Q9BTV4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM43Q9BTV4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM43Q9BTV4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM43Q9BTV4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM43Q9BTV4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM43Q9BTV4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM43Q9BTV4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM43Q9BTV4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM43Q9BTV4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM43Q9BTV4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM43Q9BTV4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM43Q9BTV4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM43Q9BTV4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM43Q9BTV4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM43Q9BTV4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM43Q9BTV4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM43Q9BTV4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM43Q9BTV4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM43Q9BTV4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM43Q9BTV4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM43Q9BTV4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM43Q9BTV4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM43Q9BTV4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM43Q9BTV4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM43Q9BTV4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM43Q9BTV4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM43Q9BTV4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM43Q9BTV4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM43Q9BTV4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM43Q9BTV4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM43Q9BTV4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM43Q9BTV4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM43Q9BTV4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM43Q9BTV4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM43Q9BTV4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM43Q9BTV4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM43Q9BTV4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM43Q9BTV4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM43Q9BTV4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM43Q9BTV4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM43Q9BTV4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM43Q9BTV4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM43Q9BTV4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms