Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SYT11Q9BT88 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYT11Q9BT88 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYT11Q9BT88 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYT11Q9BT88 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYT11Q9BT88 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYT11Q9BT88 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYT11Q9BT88 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYT11Q9BT88 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYT11Q9BT88 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYT11Q9BT88 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYT11Q9BT88 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYT11Q9BT88 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SYT11Q9BT88 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYT11Q9BT88 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYT11Q9BT88 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYT11Q9BT88 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYT11Q9BT88 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYT11Q9BT88 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYT11Q9BT88 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYT11Q9BT88 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYT11Q9BT88 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYT11Q9BT88 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYT11Q9BT88 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYT11Q9BT88 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYT11Q9BT88 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYT11Q9BT88 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYT11Q9BT88 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYT11Q9BT88 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SYT11Q9BT88 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYT11Q9BT88 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYT11Q9BT88 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYT11Q9BT88 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYT11Q9BT88 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYT11Q9BT88 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SYT11Q9BT88 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SYT11Q9BT88 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYT11Q9BT88 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYT11Q9BT88 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYT11Q9BT88 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYT11Q9BT88 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYT11Q9BT88 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYT11Q9BT88 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYT11Q9BT88 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYT11Q9BT88 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYT11Q9BT88 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYT11Q9BT88 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYT11Q9BT88 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SYT11Q9BT88 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYT11Q9BT88 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYT11Q9BT88 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SYT11Q9BT88 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYT11Q9BT88 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYT11Q9BT88 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYT11Q9BT88 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYT11Q9BT88 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYT11Q9BT88 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYT11Q9BT88 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYT11Q9BT88 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYT11Q9BT88 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SYT11Q9BT88 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYT11Q9BT88 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYT11Q9BT88 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYT11Q9BT88 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SYT11Q9BT88 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SYT11Q9BT88 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYT11Q9BT88 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT11Q9BT88 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT11Q9BT88 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT11Q9BT88 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT11Q9BT88 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT11Q9BT88 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT11Q9BT88 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT11Q9BT88 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYT11Q9BT88 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYT11Q9BT88 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SYT11Q9BT88 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYT11Q9BT88 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYT11Q9BT88 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYT11Q9BT88 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT11Q9BT88 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT11Q9BT88 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT11Q9BT88 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT11Q9BT88 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT11Q9BT88 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYT11Q9BT88 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYT11Q9BT88 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYT11Q9BT88 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYT11Q9BT88 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYT11Q9BT88 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SYT11Q9BT88 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYT11Q9BT88 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYT11Q9BT88 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYT11Q9BT88 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYT11Q9BT88 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYT11Q9BT88 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYT11Q9BT88 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYT11Q9BT88 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYT11Q9BT88 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYT11Q9BT88 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms