Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPK3BQ9BT76 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UPK3BQ9BT76 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPK3BQ9BT76 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms