Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTKNQ9BST9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTKNQ9BST9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTKNQ9BST9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTKNQ9BST9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTKNQ9BST9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTKNQ9BST9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTKNQ9BST9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTKNQ9BST9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTKNQ9BST9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTKNQ9BST9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTKNQ9BST9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RTKNQ9BST9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RTKNQ9BST9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTKNQ9BST9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTKNQ9BST9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTKNQ9BST9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RTKNQ9BST9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTKNQ9BST9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTKNQ9BST9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTKNQ9BST9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTKNQ9BST9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTKNQ9BST9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTKNQ9BST9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTKNQ9BST9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTKNQ9BST9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTKNQ9BST9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTKNQ9BST9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTKNQ9BST9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTKNQ9BST9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTKNQ9BST9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTKNQ9BST9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTKNQ9BST9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTKNQ9BST9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTKNQ9BST9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTKNQ9BST9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTKNQ9BST9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTKNQ9BST9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTKNQ9BST9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTKNQ9BST9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTKNQ9BST9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTKNQ9BST9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTKNQ9BST9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTKNQ9BST9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTKNQ9BST9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTKNQ9BST9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RTKNQ9BST9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTKNQ9BST9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTKNQ9BST9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTKNQ9BST9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTKNQ9BST9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTKNQ9BST9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTKNQ9BST9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTKNQ9BST9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTKNQ9BST9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTKNQ9BST9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTKNQ9BST9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTKNQ9BST9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTKNQ9BST9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RTKNQ9BST9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTKNQ9BST9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTKNQ9BST9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTKNQ9BST9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTKNQ9BST9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTKNQ9BST9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTKNQ9BST9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTKNQ9BST9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTKNQ9BST9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTKNQ9BST9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RTKNQ9BST9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTKNQ9BST9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTKNQ9BST9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTKNQ9BST9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTKNQ9BST9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTKNQ9BST9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTKNQ9BST9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTKNQ9BST9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTKNQ9BST9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTKNQ9BST9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTKNQ9BST9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTKNQ9BST9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTKNQ9BST9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTKNQ9BST9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTKNQ9BST9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTKNQ9BST9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTKNQ9BST9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTKNQ9BST9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTKNQ9BST9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTKNQ9BST9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTKNQ9BST9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RTKNQ9BST9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTKNQ9BST9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTKNQ9BST9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTKNQ9BST9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RTKNQ9BST9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTKNQ9BST9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTKNQ9BST9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTKNQ9BST9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTKNQ9BST9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTKNQ9BST9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms