Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRADC1Q9BSG0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRADC1Q9BSG0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRADC1Q9BSG0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRADC1Q9BSG0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRADC1Q9BSG0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRADC1Q9BSG0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PRADC1Q9BSG0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRADC1Q9BSG0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRADC1Q9BSG0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRADC1Q9BSG0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRADC1Q9BSG0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PRADC1Q9BSG0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRADC1Q9BSG0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRADC1Q9BSG0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRADC1Q9BSG0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRADC1Q9BSG0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRADC1Q9BSG0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRADC1Q9BSG0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRADC1Q9BSG0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRADC1Q9BSG0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRADC1Q9BSG0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRADC1Q9BSG0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRADC1Q9BSG0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRADC1Q9BSG0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRADC1Q9BSG0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRADC1Q9BSG0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRADC1Q9BSG0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRADC1Q9BSG0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRADC1Q9BSG0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRADC1Q9BSG0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRADC1Q9BSG0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRADC1Q9BSG0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRADC1Q9BSG0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRADC1Q9BSG0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRADC1Q9BSG0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRADC1Q9BSG0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRADC1Q9BSG0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms