Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP7

FDXACB1, Ferredoxin-fold anticodon-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDXACB1Q9BRP7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FDXACB1Q9BRP7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FDXACB1Q9BRP7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FDXACB1Q9BRP7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FDXACB1Q9BRP7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FDXACB1Q9BRP7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FDXACB1Q9BRP7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FDXACB1Q9BRP7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FDXACB1Q9BRP7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FDXACB1Q9BRP7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FDXACB1Q9BRP7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FDXACB1Q9BRP7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FDXACB1Q9BRP7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FDXACB1Q9BRP7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FDXACB1Q9BRP7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
FDXACB1Q9BRP7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FDXACB1Q9BRP7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FDXACB1Q9BRP7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FDXACB1Q9BRP7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FDXACB1Q9BRP7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FDXACB1Q9BRP7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FDXACB1Q9BRP7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FDXACB1Q9BRP7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FDXACB1Q9BRP7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FDXACB1Q9BRP7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FDXACB1Q9BRP7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FDXACB1Q9BRP7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FDXACB1Q9BRP7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FDXACB1Q9BRP7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FDXACB1Q9BRP7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FDXACB1Q9BRP7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FDXACB1Q9BRP7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FDXACB1Q9BRP7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FDXACB1Q9BRP7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FDXACB1Q9BRP7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FDXACB1Q9BRP7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FDXACB1Q9BRP7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FDXACB1Q9BRP7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FDXACB1Q9BRP7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FDXACB1Q9BRP7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FDXACB1Q9BRP7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FDXACB1Q9BRP7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FDXACB1Q9BRP7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FDXACB1Q9BRP7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FDXACB1Q9BRP7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FDXACB1Q9BRP7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FDXACB1Q9BRP7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
FDXACB1Q9BRP7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FDXACB1Q9BRP7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FDXACB1Q9BRP7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FDXACB1Q9BRP7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FDXACB1Q9BRP7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FDXACB1Q9BRP7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FDXACB1Q9BRP7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FDXACB1Q9BRP7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FDXACB1Q9BRP7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FDXACB1Q9BRP7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FDXACB1Q9BRP7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FDXACB1Q9BRP7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FDXACB1Q9BRP7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FDXACB1Q9BRP7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FDXACB1Q9BRP7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FDXACB1Q9BRP7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FDXACB1Q9BRP7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FDXACB1Q9BRP7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FDXACB1Q9BRP7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FDXACB1Q9BRP7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 240 ms