Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC77Q9BR77 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC77Q9BR77 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC77Q9BR77 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC77Q9BR77 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC77Q9BR77 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC77Q9BR77 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC77Q9BR77 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC77Q9BR77 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC77Q9BR77 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC77Q9BR77 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC77Q9BR77 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC77Q9BR77 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC77Q9BR77 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC77Q9BR77 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC77Q9BR77 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC77Q9BR77 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC77Q9BR77 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC77Q9BR77 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC77Q9BR77 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC77Q9BR77 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC77Q9BR77 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC77Q9BR77 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC77Q9BR77 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC77Q9BR77 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC77Q9BR77 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC77Q9BR77 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC77Q9BR77 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC77Q9BR77 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC77Q9BR77 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC77Q9BR77 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC77Q9BR77 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC77Q9BR77 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC77Q9BR77 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC77Q9BR77 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC77Q9BR77 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC77Q9BR77 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC77Q9BR77 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC77Q9BR77 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC77Q9BR77 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC77Q9BR77 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC77Q9BR77 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC77Q9BR77 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC77Q9BR77 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC77Q9BR77 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC77Q9BR77 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC77Q9BR77 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC77Q9BR77 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC77Q9BR77 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC77Q9BR77 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC77Q9BR77 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC77Q9BR77 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC77Q9BR77 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC77Q9BR77 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC77Q9BR77 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC77Q9BR77 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC77Q9BR77 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC77Q9BR77 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC77Q9BR77 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC77Q9BR77 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC77Q9BR77 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC77Q9BR77 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC77Q9BR77 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC77Q9BR77 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC77Q9BR77 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC77Q9BR77 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC77Q9BR77 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC77Q9BR77 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC77Q9BR77 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC77Q9BR77 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC77Q9BR77 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC77Q9BR77 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms