Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BPIFA3Q9BQP9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BPIFA3Q9BQP9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BPIFA3Q9BQP9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BPIFA3Q9BQP9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BPIFA3Q9BQP9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BPIFA3Q9BQP9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BPIFA3Q9BQP9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BPIFA3Q9BQP9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BPIFA3Q9BQP9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BPIFA3Q9BQP9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BPIFA3Q9BQP9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BPIFA3Q9BQP9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BPIFA3Q9BQP9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BPIFA3Q9BQP9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BPIFA3Q9BQP9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BPIFA3Q9BQP9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BPIFA3Q9BQP9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
BPIFA3Q9BQP9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BPIFA3Q9BQP9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BPIFA3Q9BQP9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BPIFA3Q9BQP9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BPIFA3Q9BQP9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BPIFA3Q9BQP9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BPIFA3Q9BQP9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BPIFA3Q9BQP9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BPIFA3Q9BQP9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
BPIFA3Q9BQP9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BPIFA3Q9BQP9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BPIFA3Q9BQP9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BPIFA3Q9BQP9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BPIFA3Q9BQP9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
BPIFA3Q9BQP9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BPIFA3Q9BQP9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BPIFA3Q9BQP9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
BPIFA3Q9BQP9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BPIFA3Q9BQP9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BPIFA3Q9BQP9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BPIFA3Q9BQP9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BPIFA3Q9BQP9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BPIFA3Q9BQP9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BPIFA3Q9BQP9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BPIFA3Q9BQP9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BPIFA3Q9BQP9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BPIFA3Q9BQP9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BPIFA3Q9BQP9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BPIFA3Q9BQP9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
BPIFA3Q9BQP9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BPIFA3Q9BQP9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BPIFA3Q9BQP9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BPIFA3Q9BQP9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BPIFA3Q9BQP9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
BPIFA3Q9BQP9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
BPIFA3Q9BQP9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BPIFA3Q9BQP9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BPIFA3Q9BQP9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BPIFA3Q9BQP9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BPIFA3Q9BQP9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BPIFA3Q9BQP9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BPIFA3Q9BQP9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BPIFA3Q9BQP9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BPIFA3Q9BQP9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BPIFA3Q9BQP9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BPIFA3Q9BQP9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BPIFA3Q9BQP9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BPIFA3Q9BQP9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BPIFA3Q9BQP9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BPIFA3Q9BQP9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BPIFA3Q9BQP9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BPIFA3Q9BQP9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BPIFA3Q9BQP9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BPIFA3Q9BQP9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BPIFA3Q9BQP9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BPIFA3Q9BQP9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BPIFA3Q9BQP9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BPIFA3Q9BQP9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BPIFA3Q9BQP9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
BPIFA3Q9BQP9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BPIFA3Q9BQP9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BPIFA3Q9BQP9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BPIFA3Q9BQP9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BPIFA3Q9BQP9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BPIFA3Q9BQP9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BPIFA3Q9BQP9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BPIFA3Q9BQP9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BPIFA3Q9BQP9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BPIFA3Q9BQP9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
BPIFA3Q9BQP9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BPIFA3Q9BQP9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BPIFA3Q9BQP9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BPIFA3Q9BQP9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BPIFA3Q9BQP9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BPIFA3Q9BQP9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BPIFA3Q9BQP9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BPIFA3Q9BQP9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BPIFA3Q9BQP9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BPIFA3Q9BQP9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BPIFA3Q9BQP9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BPIFA3Q9BQP9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BPIFA3Q9BQP9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms