Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLRE1CQ96SD1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLRE1CQ96SD1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLRE1CQ96SD1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLRE1CQ96SD1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLRE1CQ96SD1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLRE1CQ96SD1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLRE1CQ96SD1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLRE1CQ96SD1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLRE1CQ96SD1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLRE1CQ96SD1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLRE1CQ96SD1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLRE1CQ96SD1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLRE1CQ96SD1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLRE1CQ96SD1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLRE1CQ96SD1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLRE1CQ96SD1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLRE1CQ96SD1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLRE1CQ96SD1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLRE1CQ96SD1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLRE1CQ96SD1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLRE1CQ96SD1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLRE1CQ96SD1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLRE1CQ96SD1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCLRE1CQ96SD1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCLRE1CQ96SD1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCLRE1CQ96SD1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCLRE1CQ96SD1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCLRE1CQ96SD1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DCLRE1CQ96SD1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCLRE1CQ96SD1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCLRE1CQ96SD1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCLRE1CQ96SD1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCLRE1CQ96SD1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCLRE1CQ96SD1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCLRE1CQ96SD1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCLRE1CQ96SD1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCLRE1CQ96SD1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCLRE1CQ96SD1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCLRE1CQ96SD1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCLRE1CQ96SD1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCLRE1CQ96SD1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCLRE1CQ96SD1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCLRE1CQ96SD1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCLRE1CQ96SD1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCLRE1CQ96SD1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCLRE1CQ96SD1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DCLRE1CQ96SD1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCLRE1CQ96SD1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCLRE1CQ96SD1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DCLRE1CQ96SD1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCLRE1CQ96SD1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCLRE1CQ96SD1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCLRE1CQ96SD1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCLRE1CQ96SD1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCLRE1CQ96SD1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCLRE1CQ96SD1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLRE1CQ96SD1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLRE1CQ96SD1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLRE1CQ96SD1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLRE1CQ96SD1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLRE1CQ96SD1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLRE1CQ96SD1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLRE1CQ96SD1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLRE1CQ96SD1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLRE1CQ96SD1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLRE1CQ96SD1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLRE1CQ96SD1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLRE1CQ96SD1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLRE1CQ96SD1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLRE1CQ96SD1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms