Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF13CQ96RJ3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF13CQ96RJ3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF13CQ96RJ3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF13CQ96RJ3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF13CQ96RJ3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF13CQ96RJ3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF13CQ96RJ3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF13CQ96RJ3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF13CQ96RJ3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF13CQ96RJ3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF13CQ96RJ3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF13CQ96RJ3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNFRSF13CQ96RJ3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF13CQ96RJ3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF13CQ96RJ3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF13CQ96RJ3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF13CQ96RJ3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF13CQ96RJ3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF13CQ96RJ3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF13CQ96RJ3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF13CQ96RJ3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF13CQ96RJ3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF13CQ96RJ3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF13CQ96RJ3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF13CQ96RJ3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF13CQ96RJ3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF13CQ96RJ3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF13CQ96RJ3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF13CQ96RJ3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF13CQ96RJ3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF13CQ96RJ3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF13CQ96RJ3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF13CQ96RJ3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF13CQ96RJ3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF13CQ96RJ3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF13CQ96RJ3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF13CQ96RJ3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF13CQ96RJ3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms