Protein–RNA interactions for Protein: Q96QA5

GSDMA, Gasdermin-A, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMAQ96QA5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GSDMAQ96QA5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GSDMAQ96QA5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GSDMAQ96QA5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GSDMAQ96QA5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GSDMAQ96QA5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GSDMAQ96QA5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GSDMAQ96QA5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GSDMAQ96QA5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GSDMAQ96QA5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GSDMAQ96QA5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GSDMAQ96QA5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GSDMAQ96QA5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GSDMAQ96QA5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GSDMAQ96QA5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GSDMAQ96QA5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GSDMAQ96QA5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GSDMAQ96QA5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GSDMAQ96QA5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GSDMAQ96QA5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GSDMAQ96QA5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GSDMAQ96QA5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GSDMAQ96QA5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GSDMAQ96QA5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GSDMAQ96QA5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GSDMAQ96QA5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GSDMAQ96QA5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GSDMAQ96QA5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GSDMAQ96QA5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GSDMAQ96QA5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GSDMAQ96QA5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GSDMAQ96QA5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GSDMAQ96QA5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GSDMAQ96QA5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GSDMAQ96QA5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GSDMAQ96QA5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GSDMAQ96QA5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GSDMAQ96QA5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GSDMAQ96QA5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
GSDMAQ96QA5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GSDMAQ96QA5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GSDMAQ96QA5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GSDMAQ96QA5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GSDMAQ96QA5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GSDMAQ96QA5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GSDMAQ96QA5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GSDMAQ96QA5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GSDMAQ96QA5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GSDMAQ96QA5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GSDMAQ96QA5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GSDMAQ96QA5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GSDMAQ96QA5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GSDMAQ96QA5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GSDMAQ96QA5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GSDMAQ96QA5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GSDMAQ96QA5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GSDMAQ96QA5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GSDMAQ96QA5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GSDMAQ96QA5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GSDMAQ96QA5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GSDMAQ96QA5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GSDMAQ96QA5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GSDMAQ96QA5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GSDMAQ96QA5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GSDMAQ96QA5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GSDMAQ96QA5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GSDMAQ96QA5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GSDMAQ96QA5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GSDMAQ96QA5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GSDMAQ96QA5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GSDMAQ96QA5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GSDMAQ96QA5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GSDMAQ96QA5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GSDMAQ96QA5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GSDMAQ96QA5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GSDMAQ96QA5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GSDMAQ96QA5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GSDMAQ96QA5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GSDMAQ96QA5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GSDMAQ96QA5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GSDMAQ96QA5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GSDMAQ96QA5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GSDMAQ96QA5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GSDMAQ96QA5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GSDMAQ96QA5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GSDMAQ96QA5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GSDMAQ96QA5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GSDMAQ96QA5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GSDMAQ96QA5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GSDMAQ96QA5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GSDMAQ96QA5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GSDMAQ96QA5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GSDMAQ96QA5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GSDMAQ96QA5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GSDMAQ96QA5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GSDMAQ96QA5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GSDMAQ96QA5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GSDMAQ96QA5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GSDMAQ96QA5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GSDMAQ96QA5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms