Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
GBP4Q96PP9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GBP4Q96PP9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GBP4Q96PP9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GBP4Q96PP9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GBP4Q96PP9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GBP4Q96PP9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GBP4Q96PP9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GBP4Q96PP9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GBP4Q96PP9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
GBP4Q96PP9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GBP4Q96PP9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GBP4Q96PP9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GBP4Q96PP9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GBP4Q96PP9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GBP4Q96PP9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GBP4Q96PP9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GBP4Q96PP9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GBP4Q96PP9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GBP4Q96PP9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GBP4Q96PP9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GBP4Q96PP9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms