Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN8

TSSK3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK3Q96PN8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSSK3Q96PN8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSSK3Q96PN8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSSK3Q96PN8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSSK3Q96PN8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSSK3Q96PN8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSSK3Q96PN8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSSK3Q96PN8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSSK3Q96PN8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSSK3Q96PN8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSSK3Q96PN8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSSK3Q96PN8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSSK3Q96PN8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSSK3Q96PN8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSSK3Q96PN8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSSK3Q96PN8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSSK3Q96PN8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TSSK3Q96PN8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSSK3Q96PN8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSSK3Q96PN8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSSK3Q96PN8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSSK3Q96PN8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSSK3Q96PN8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSSK3Q96PN8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSSK3Q96PN8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSSK3Q96PN8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSSK3Q96PN8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSSK3Q96PN8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSSK3Q96PN8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSSK3Q96PN8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSSK3Q96PN8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSSK3Q96PN8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSSK3Q96PN8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSSK3Q96PN8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSSK3Q96PN8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSSK3Q96PN8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSSK3Q96PN8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSSK3Q96PN8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSSK3Q96PN8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSSK3Q96PN8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSSK3Q96PN8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSSK3Q96PN8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSSK3Q96PN8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSSK3Q96PN8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSSK3Q96PN8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TSSK3Q96PN8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TSSK3Q96PN8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSSK3Q96PN8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSSK3Q96PN8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TSSK3Q96PN8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSSK3Q96PN8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSSK3Q96PN8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSSK3Q96PN8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSSK3Q96PN8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSSK3Q96PN8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSSK3Q96PN8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSSK3Q96PN8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSSK3Q96PN8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSSK3Q96PN8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TSSK3Q96PN8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSSK3Q96PN8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSSK3Q96PN8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSSK3Q96PN8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSSK3Q96PN8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSSK3Q96PN8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSSK3Q96PN8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSSK3Q96PN8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSSK3Q96PN8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSSK3Q96PN8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSSK3Q96PN8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSSK3Q96PN8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSSK3Q96PN8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSSK3Q96PN8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSSK3Q96PN8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSSK3Q96PN8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSSK3Q96PN8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSSK3Q96PN8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms