Protein–RNA interactions for Protein: Q96NI6

LRFN5, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN5Q96NI6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRFN5Q96NI6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRFN5Q96NI6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRFN5Q96NI6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRFN5Q96NI6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRFN5Q96NI6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRFN5Q96NI6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRFN5Q96NI6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRFN5Q96NI6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRFN5Q96NI6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRFN5Q96NI6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRFN5Q96NI6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRFN5Q96NI6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRFN5Q96NI6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRFN5Q96NI6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRFN5Q96NI6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRFN5Q96NI6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRFN5Q96NI6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRFN5Q96NI6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRFN5Q96NI6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRFN5Q96NI6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRFN5Q96NI6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRFN5Q96NI6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRFN5Q96NI6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRFN5Q96NI6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN5Q96NI6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN5Q96NI6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN5Q96NI6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN5Q96NI6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN5Q96NI6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRFN5Q96NI6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRFN5Q96NI6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRFN5Q96NI6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRFN5Q96NI6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRFN5Q96NI6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRFN5Q96NI6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRFN5Q96NI6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRFN5Q96NI6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRFN5Q96NI6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRFN5Q96NI6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRFN5Q96NI6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRFN5Q96NI6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRFN5Q96NI6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRFN5Q96NI6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRFN5Q96NI6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRFN5Q96NI6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRFN5Q96NI6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRFN5Q96NI6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN5Q96NI6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN5Q96NI6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN5Q96NI6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN5Q96NI6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN5Q96NI6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN5Q96NI6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN5Q96NI6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN5Q96NI6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN5Q96NI6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN5Q96NI6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRFN5Q96NI6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRFN5Q96NI6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRFN5Q96NI6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN5Q96NI6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN5Q96NI6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN5Q96NI6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRFN5Q96NI6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms