Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNF396Q96N95 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNF396Q96N95 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZNF396Q96N95 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZNF396Q96N95 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF396Q96N95 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF396Q96N95 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF396Q96N95 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF396Q96N95 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF396Q96N95 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF396Q96N95 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF396Q96N95 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF396Q96N95 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF396Q96N95 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF396Q96N95 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF396Q96N95 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF396Q96N95 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF396Q96N95 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF396Q96N95 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF396Q96N95 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF396Q96N95 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF396Q96N95 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF396Q96N95 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF396Q96N95 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF396Q96N95 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF396Q96N95 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF396Q96N95 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF396Q96N95 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF396Q96N95 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF396Q96N95 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF396Q96N95 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF396Q96N95 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF396Q96N95 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF396Q96N95 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF396Q96N95 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF396Q96N95 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF396Q96N95 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF396Q96N95 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF396Q96N95 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF396Q96N95 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF396Q96N95 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF396Q96N95 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF396Q96N95 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF396Q96N95 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF396Q96N95 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF396Q96N95 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF396Q96N95 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF396Q96N95 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF396Q96N95 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF396Q96N95 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF396Q96N95 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF396Q96N95 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF396Q96N95 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF396Q96N95 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF396Q96N95 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF396Q96N95 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF396Q96N95 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF396Q96N95 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF396Q96N95 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF396Q96N95 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF396Q96N95 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF396Q96N95 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF396Q96N95 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF396Q96N95 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF396Q96N95 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF396Q96N95 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF396Q96N95 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF396Q96N95 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF396Q96N95 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF396Q96N95 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF396Q96N95 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF396Q96N95 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF396Q96N95 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF396Q96N95 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
ZNF396Q96N95 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
ZNF396Q96N95 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF396Q96N95 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF396Q96N95 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF396Q96N95 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF396Q96N95 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF396Q96N95 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF396Q96N95 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF396Q96N95 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF396Q96N95 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF396Q96N95 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF396Q96N95 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF396Q96N95 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF396Q96N95 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF396Q96N95 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF396Q96N95 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF396Q96N95 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF396Q96N95 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF396Q96N95 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF396Q96N95 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF396Q96N95 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZNF396Q96N95 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF396Q96N95 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF396Q96N95 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF396Q96N95 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF396Q96N95 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms