Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
YTHDC1Q96MU7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
YTHDC1Q96MU7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
YTHDC1Q96MU7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
YTHDC1Q96MU7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
YTHDC1Q96MU7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
YTHDC1Q96MU7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
YTHDC1Q96MU7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
YTHDC1Q96MU7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
YTHDC1Q96MU7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
YTHDC1Q96MU7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
YTHDC1Q96MU7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
YTHDC1Q96MU7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
YTHDC1Q96MU7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
YTHDC1Q96MU7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
YTHDC1Q96MU7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
YTHDC1Q96MU7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
YTHDC1Q96MU7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
YTHDC1Q96MU7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
YTHDC1Q96MU7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
YTHDC1Q96MU7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
YTHDC1Q96MU7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
YTHDC1Q96MU7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
YTHDC1Q96MU7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
YTHDC1Q96MU7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
YTHDC1Q96MU7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
YTHDC1Q96MU7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
YTHDC1Q96MU7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
YTHDC1Q96MU7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
YTHDC1Q96MU7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
YTHDC1Q96MU7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
YTHDC1Q96MU7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
YTHDC1Q96MU7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
YTHDC1Q96MU7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
YTHDC1Q96MU7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
YTHDC1Q96MU7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
YTHDC1Q96MU7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
YTHDC1Q96MU7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
YTHDC1Q96MU7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
YTHDC1Q96MU7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
YTHDC1Q96MU7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
YTHDC1Q96MU7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
YTHDC1Q96MU7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
YTHDC1Q96MU7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
YTHDC1Q96MU7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
YTHDC1Q96MU7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
YTHDC1Q96MU7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
YTHDC1Q96MU7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
YTHDC1Q96MU7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
YTHDC1Q96MU7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
YTHDC1Q96MU7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
YTHDC1Q96MU7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
YTHDC1Q96MU7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
YTHDC1Q96MU7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
YTHDC1Q96MU7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
YTHDC1Q96MU7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
YTHDC1Q96MU7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
YTHDC1Q96MU7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
YTHDC1Q96MU7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
YTHDC1Q96MU7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
YTHDC1Q96MU7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
YTHDC1Q96MU7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
YTHDC1Q96MU7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
YTHDC1Q96MU7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
YTHDC1Q96MU7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
YTHDC1Q96MU7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
YTHDC1Q96MU7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
YTHDC1Q96MU7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
YTHDC1Q96MU7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
YTHDC1Q96MU7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
YTHDC1Q96MU7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
YTHDC1Q96MU7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
YTHDC1Q96MU7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
YTHDC1Q96MU7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
YTHDC1Q96MU7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
YTHDC1Q96MU7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
YTHDC1Q96MU7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
YTHDC1Q96MU7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
YTHDC1Q96MU7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
YTHDC1Q96MU7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
YTHDC1Q96MU7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
YTHDC1Q96MU7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
YTHDC1Q96MU7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
YTHDC1Q96MU7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
YTHDC1Q96MU7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
YTHDC1Q96MU7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
YTHDC1Q96MU7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
YTHDC1Q96MU7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
YTHDC1Q96MU7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
YTHDC1Q96MU7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
YTHDC1Q96MU7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
YTHDC1Q96MU7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
YTHDC1Q96MU7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
YTHDC1Q96MU7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
YTHDC1Q96MU7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
YTHDC1Q96MU7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
YTHDC1Q96MU7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
YTHDC1Q96MU7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
YTHDC1Q96MU7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
YTHDC1Q96MU7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms