Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM71F1Q96KD3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM71F1Q96KD3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM71F1Q96KD3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM71F1Q96KD3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM71F1Q96KD3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM71F1Q96KD3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM71F1Q96KD3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM71F1Q96KD3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM71F1Q96KD3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM71F1Q96KD3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM71F1Q96KD3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM71F1Q96KD3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM71F1Q96KD3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM71F1Q96KD3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM71F1Q96KD3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM71F1Q96KD3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM71F1Q96KD3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM71F1Q96KD3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM71F1Q96KD3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71F1Q96KD3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM71F1Q96KD3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM71F1Q96KD3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM71F1Q96KD3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71F1Q96KD3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71F1Q96KD3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71F1Q96KD3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71F1Q96KD3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71F1Q96KD3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71F1Q96KD3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71F1Q96KD3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71F1Q96KD3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71F1Q96KD3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71F1Q96KD3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71F1Q96KD3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71F1Q96KD3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71F1Q96KD3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71F1Q96KD3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71F1Q96KD3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71F1Q96KD3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71F1Q96KD3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71F1Q96KD3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71F1Q96KD3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM71F1Q96KD3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms